Skip to main content

Table 2 IPS result overview (whole article collection)

From: Overview of the protein-protein interaction annotation extraction task of BioCreative II

Team

Run

Precision

Recall

F score

4

1

0.3893

0.3073

0.2885

6

1

0.2758

0.3011

0.2532

6

2

0.2218

0.2592

0.2066

6

3

0.2392

0.3035

0.2272

11

1

0.0510

0.2753

0.0717

11

2

0.0510

0.2753

0.0717

11

3

0.0517

0.2776

0.0726

14

1

0.1791

0.1421

0.1384

14

2

0.1944

0.1300

0.1414

14

3

0.1162

0.1057

0.0985

17

1

0.0413

0.2543

0.0631

17

2

0.1018

0.2012

0.1182

17

3

0.1633

0.2066

0.1599

19

1

0.0854

0.2115

0.1036

19

2

0.1144

0.2681

0.1361

19

3

0.1595

0.2466

0.1690

28

1

0.1373

0.2905

0.1579

28

2

0.2177

0.2651

0.2039

28

3

0.3096

0.2935

0.2623

30

1

0.0551

0.1888

0.0731

30

2

0.0345

0.2352

0.0528

30

3

0.1574

0.1846

0.1382

36

1

0.0441

0.1121

0.0503

36

2

0.0229

0.0990

0.0305

36

3

0.0548

0.1350

0.0680

40

1

0.0762

0.2489

0.0990

40

2

0.2632

0.2484

0.2171

42

1

0.0160

0.4167

0.0280

42

2

0.2384

0.2218

0.2014

42

3

0.2101

0.2024

0.1827

43

1

0.0395

0.0846

0.0424

43

2

0.0828

0.0680

0.0653

43

3

0.0620

0.0867

0.0592

47

1

0.0830

0.1891

0.0910

47

2

0.0889

0.1909

0.0950

47

3

0.0747

0.1855

0.0844

49

1

0.0109

0.1092

0.0185

49

2

0.0289

0.0557

0.0345

49

3

0.0255

0.0865

0.0357

58

1

0.0003

0.0006

0.0004

58

2

0.0003

0.0006

0.0004

58

3

0.0004

0.0006

0.0005

60

1

0.0323

0.0942

0.0362

60

2

0.0162

0.0558

0.0205

60

3

0.0251

0.0654

0.0299

  1. Interaction pair subtask (IPS) results for the whole article set. The average precision, recall, and F score obtained for each of the test set submissions are shown.