From: A TATA binding protein regulatory network that governs transcription complex assembly
 |  | Cluster number†| |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Row‡ | Property | 0 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 |
 | Environmental stress |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |
1 | Induced during heat stress | -25 | -6 | ... | 8 | ... | 30 | 35 | ... | ... | ... |
2 | Repressed during heat stress | -7 | 106 | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... |
 | Gene ontology § |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |
3 | RB genes¶ | ... | 69 | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... |
4 | RP genes¶ | ... | ... | ... | ... | -4 | ... | ... | ... | 31 | 14 |
5 | Oxidative phosphorylation {GO:6119} | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | 13 |
6 | Amine metabolism {GO:9308} | ... | ... | ... | 8 | ... | ... | ... | ... | ... | ... |
7 | Alcohol metabolism {GO:6066} | ... | ... | ... | 5 | ... | 9 | 4 | ... | ... | ... |
8 | Energy derivation {GO:15980} | ... | ... | ... | ... | ... | 6 | 13 | ... | ... | 5 |
9 | Sporulation {GO:30435} | ... | ... | ... | ... | 4 | ... | ... | ... | ... | ... |
10 | Ty element transposition {GO:6319} | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | 6 | ... | ... |
11 | Proteolysis {GO:6508} | ... | ... | 6 | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... |
 | General properties |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |
12 | Lowly transcribed | 84 | ... | ... | ... | 89 | ... | ... | 10 | ... | ... |
13 | Highly transcribed | ... | ... | ... | ... | -7 | ... | ... | ... | 12 | 21 |
14 | Low mRNA levels | 14 | ... | ... | ... | 28 | -5 | -6 | ... | ... | ... |
15 | High mRNA levels | -7 | -6 | ... | ... | -7 | ... | 32 | ... | 8 | 21 |
16 | SAGA-dominated | -46 | ... | ... | 9 | ... | 53 | 43 | ... | ... | ... |
17 | TATA-containing | -52 | -6 | ... | 9 | 12 | 45 | 46 | ... | ... | 4 |
18 | Low H3 K4Me2 in ORF | ... | ... | ... | ... | 58 | ... | ... | ... | ... | ... |
19 | Low H3 K4Me2 in IGR | ... | ... | ... | ... | 28 | ... | ... | ... | ... | ... |
 | Positively regulated by |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |
20 | Spt3 (SAGA) | -31 | -4 | -7 | ... | 28 | 5 | 31 | 28 | ... | ... |
21 | Mot1 | ... | ... | ... | ... | -4 | -6 | ... | ... | 27 | 8 |
22 | Bur6 (NC2) | 13 | 15 | ... | ... | ... | -5 | ... | ... | 17 | ... |
23 | Bdf1 (TFIID) | 11 | ... | ... | ... | ... | ... | ... | 10 | 6 | ... |
24 | Bdf2 | ... | ... | ... | ... | 20 | ... | ... | ... | ... | ... |
25 | TAF1 (TFIID) | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | 10 | 5 |
 | Negatively regulated by |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |
26 | RP genes | ... | ¥ | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... |
27 | Spt3 (SAGA) | -8 | 6 | 27 | 30 | ... | ... | ... | -5 | ... | ... |
28 | Mot1 | -25 | ... | ... | 15 | 22 | 36 | 5 | ... | -6 | ... |
29 | Bur6 (NC2) | -28 | ... | ... | 5 | 13 | 43 | 9 | ... | -4 | ... |
30 | Bdf1 (TFIID) | -21 | ... | ... | 10 | ... | 25 | 8 | ... | ... | ... |
31 | Hda1 | -23 | ... | ... | ... | 25 | 11 | 5 | 5 | ... | ... |
32 | Tup1 (SSN6-TUP1) | -31 | ... | -4 | ... | 52 | 12 | 11 | 17 | ... | ... |
33 | Set1 (COMPASS) | -8 | ... | -6 | ... | 60 | ... | ... | 15 | ... | ... |