Skip to main content

Table 1 Pairwise differences between maize breeding programs in the USA.a

From: Comprehensive genotyping of the USA national maize inbred seed bank

  IL IN IA MI MN MO NE NC ND W Mon Pion
Illinois (IL)   0.14 0.96 0.14 0.99 0.14 0.98 0.14 0.97 0.15 0.98 0.14 0.98 0.14 0.98 0.15 0.93 0.15 0.98 0.14 0.98 0.14 0.95
Indiana (IN) 0.01   0.14 0.99 0.14 0.95 0.14 0.98 0.15 0.99 0.14 0.96 0.14 0.96 0.15 0.92 0.15 0.96 0.14 0.96 0.14 0.96
Iowa (IA) 0.01 0.01   0.14 0.93 0.14 0.99 0.15 0.99 0.13 0.99 0.14 1.00 0.15 0.99 0.14 0.98 0.13 0.99 0.14 0.96
Michigan (MI) 0.01 0.02 0.03   0.14 0.97 0.15 0.93 0.14 0.91 0.15 0.91 0.15 0.93 0.15 0.97 0.14 0.95 0.14 0.92
Minnesota (MN) 0.02 0.02 0.02 0.02   0.15 0.96 0.14 0.98 0.15 0.99 0.15 0.94 0.14 0.99 0.14 0.98 0.14 0.95
Missouri (MO) 0.02 0.02 0.03 0.03 0.03   0.14 0.97 0.15 0.95 0.15 0.92 0.15 0.99 0.14 0.99 0.14 0.96
Nebraska (NE) 0.04 0.04 0.03 0.06 0.05 0.05   0.14 0.99 0.15 0.89 0.14 0.97 0.13 0.98 0.13 0.95
North Carolina (NC) 0.05 0.05 0.04 0.06 0.05 0.04 0.06   0.15 0.90 0.15 0.93 0.14 0.98 0.14 0.95
North Dakota (ND) 0.03 0.03 0.04 0.03 0.02 0.03 0.08 0.06   0.15 0.94 0.15 0.94 0.15 0.88
Wisconsin (WI) 0.02 0.03 0.03 0.03 0.02 0.04 0.07 0.07 0.03   0.14 0.98 0.15 0.94
Monsanto (Mon) 0.04 0.03 0.02 0.05 0.03 0.05 0.05 0.04 0.07 0.06   0.13 0.99
Pioneer (Pion) 0.04 0.04 0.03 0.05 0.04 0.04 0.06 0.06 0.07 0.06 0.03  
  1. aLower diagonal shows pairwise Fst estimates between USA breeding programs, whereas upper diagonal shows average nucleotide divergence and maximum nucleotide similarity.