Table 1 Pairwise differences between maize breeding programs in the USA.^a

From: Comprehensive genotyping of the USA national maize inbred seed bank

	IL	IN	IA	MI	MN	MO	NE	NC	ND	W	Mon	Pion
Illinois (IL)		0.14 0.96	0.14 0.99	0.14 0.98	0.14 0.97	0.15 0.98	0.14 0.98	0.14 0.98	0.15 0.93	0.15 0.98	0.14 0.98	0.14 0.95
Indiana (IN)	0.01		0.14 0.99	0.14 0.95	0.14 0.98	0.15 0.99	0.14 0.96	0.14 0.96	0.15 0.92	0.15 0.96	0.14 0.96	0.14 0.96
Iowa (IA)	0.01	0.01		0.14 0.93	0.14 0.99	0.15 0.99	0.13 0.99	0.14 1.00	0.15 0.99	0.14 0.98	0.13 0.99	0.14 0.96
Michigan (MI)	0.01	0.02	0.03		0.14 0.97	0.15 0.93	0.14 0.91	0.15 0.91	0.15 0.93	0.15 0.97	0.14 0.95	0.14 0.92
Minnesota (MN)	0.02	0.02	0.02	0.02		0.15 0.96	0.14 0.98	0.15 0.99	0.15 0.94	0.14 0.99	0.14 0.98	0.14 0.95
Missouri (MO)	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03		0.14 0.97	0.15 0.95	0.15 0.92	0.15 0.99	0.14 0.99	0.14 0.96
Nebraska (NE)	0.04	0.04	0.03	0.06	0.05	0.05		0.14 0.99	0.15 0.89	0.14 0.97	0.13 0.98	0.13 0.95
North Carolina (NC)	0.05	0.05	0.04	0.06	0.05	0.04	0.06		0.15 0.90	0.15 0.93	0.14 0.98	0.14 0.95
North Dakota (ND)	0.03	0.03	0.04	0.03	0.02	0.03	0.08	0.06		0.15 0.94	0.15 0.94	0.15 0.88
Wisconsin (WI)	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.04	0.07	0.07	0.03		0.14 0.98	0.15 0.94
Monsanto (Mon)	0.04	0.03	0.02	0.05	0.03	0.05	0.05	0.04	0.07	0.06		0.13 0.99
Pioneer (Pion)	0.04	0.04	0.03	0.05	0.04	0.04	0.06	0.06	0.07	0.06	0.03

^aLower diagonal shows pairwise Fst estimates between USA breeding programs, whereas upper diagonal shows average nucleotide divergence and maximum nucleotide similarity.

Back to article page

ISSN: 1474-760X

Contact us

Submission enquiries: editorial@genomebiology.com
General enquiries: info@biomedcentral.com