TY - JOUR AU - McClung, C. R. PY - 2011 DA - 2011// TI - The genetics of plant clocks JO - Adv Genet VL - 74 ID - McClung2011 ER - TY - JOUR AU - Gardner, M. J. AU - Hubbard, K. E. AU - Hotta, C. T. AU - Dodd, A. N. AU - Webb, A. A. PY - 2006 DA - 2006// TI - How plants tell the time JO - Biochem J VL - 397 UR - https://doi.org/10.1042/BJ20060484 DO - 10.1042/BJ20060484 ID - Gardner2006 ER - TY - JOUR AU - Nagel, D. H. AU - Kay, S. A. PY - 2012 DA - 2012// TI - Complexity in the wiring and regulation of plant circadian networks JO - Curr Biol VL - 22 UR - https://doi.org/10.1016/j.cub.2012.07.025 DO - 10.1016/j.cub.2012.07.025 ID - Nagel2012 ER - TY - JOUR AU - Troncoso-Ponce, M. A. AU - Mas, P. PY - 2012 DA - 2012// TI - Newly described components and regulatory mechanisms of circadian clock function in Arabidopsis thaliana JO - Mol Plant VL - 5 UR - https://doi.org/10.1093/mp/ssr117 DO - 10.1093/mp/ssr117 ID - Troncoso-Ponce2012 ER - TY - JOUR AU - Pokhilko, A. AU - Fernandez, A. P. AU - Edwards, K. D. AU - Southern, M. M. AU - Halliday, K. J. AU - Millar, A. J. PY - 2012 DA - 2012// TI - The clock gene circuit in Arabidopsis includes a repressilator with additional feedback loops JO - Mol Syst Biol VL - 8 UR - https://doi.org/10.1038/msb.2012.6 DO - 10.1038/msb.2012.6 ID - Pokhilko2012 ER - TY - JOUR AU - Herrero, E. AU - Davis, S. J. PY - 2012 DA - 2012// TI - Time for a nuclear meeting: protein trafficking and chromatin dynamics intersect in the plant circadian system JO - Mol Plant VL - 5 UR - https://doi.org/10.1093/mp/sss010 DO - 10.1093/mp/sss010 ID - Herrero2012 ER - TY - JOUR AU - Bujdoso, N. AU - Davis, S. J. PY - 2013 DA - 2013// TI - Mathematical modeling of an oscillating gene circuit to unravel the circadian-clock network of Arabidopsis thaliana JO - Front Plant Sci VL - 4 UR - https://doi.org/10.3389/fpls.2013.00003 DO - 10.3389/fpls.2013.00003 ID - Bujdoso2013 ER - TY - JOUR AU - Zhang, E. E. AU - Kay, S. A. PY - 2010 DA - 2010// TI - Clocks not winding down: unravelling circadian networks JO - Nat Rev Mol Cell Biol VL - 11 UR - https://doi.org/10.1038/nrm2995 DO - 10.1038/nrm2995 ID - Zhang2010 ER - TY - JOUR AU - Staiger, D. AU - Köster, T. PY - 2011 DA - 2011// TI - Spotlight on post-transcriptional control in the circadian system JO - Cell Mol Life Sci VL - 68 UR - https://doi.org/10.1007/s00018-010-0513-5 DO - 10.1007/s00018-010-0513-5 ID - Staiger2011 ER - TY - JOUR AU - Dibner, C. AU - Schibler, U. AU - Albrecht, U. PY - 2010 DA - 2010// TI - The mammalian circadian timing system: organization and coordination of central and peripheral clocks JO - Annu Rev Physiol VL - 72 UR - https://doi.org/10.1146/annurev-physiol-021909-135821 DO - 10.1146/annurev-physiol-021909-135821 ID - Dibner2010 ER - TY - JOUR AU - Kloppstech, K. PY - 1985 DA - 1985// TI - Diurnal and circadian rhythmicity in the expression of light-induced plant nuclear messenger RNAs JO - Planta VL - 165 UR - https://doi.org/10.1007/BF00398095 DO - 10.1007/BF00398095 ID - Kloppstech1985 ER - TY - JOUR AU - Harmer, S. L. AU - Hogenesch, J. B. AU - Straume, M. AU - Chang, H. S. AU - Han, B. AU - Zhu, T. AU - Wang, X. AU - Kreps, J. A. AU - Kay, S. A. PY - 2000 DA - 2000// TI - Orchestrated transcription of key pathways in Arabidopsis by the circadian clock JO - Science VL - 290 UR - https://doi.org/10.1126/science.290.5499.2110 DO - 10.1126/science.290.5499.2110 ID - Harmer2000 ER - TY - JOUR PY - 2000 DA - 2000// TI - Analysis of the genome sequence of the flowering plant Arabidopsis thaliana JO - Nature VL - 408 UR - https://doi.org/10.1038/35048692 DO - 10.1038/35048692 ID - ref13 ER - TY - JOUR AU - Michael, T. P. AU - McClung, C. R. PY - 2002 DA - 2002// TI - Phase-specific circadian clock regulatory elements in Arabidopsis JO - Plant Physiol VL - 130 UR - https://doi.org/10.1104/pp.004929 DO - 10.1104/pp.004929 ID - Michael2002 ER - TY - JOUR AU - Covington, M. F. AU - Maloof, J. N. AU - Straume, M. AU - Kay, S. A. AU - Harmer, S. L. PY - 2008 DA - 2008// TI - Global transcriptome analysis reveals circadian regulation of key pathways in plant growth and development JO - Genome Biol VL - 9 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2008-9-8-r130 DO - 10.1186/gb-2008-9-8-r130 ID - Covington2008 ER - TY - JOUR AU - Michael, T. P. AU - Mockler, T. C. AU - Breton, G. AU - McEntee, C. AU - Byer, A. AU - Trout, J. D. AU - Hazen, S. P. AU - Shen, R. AU - Priest, H. D. AU - Sullivan, C. M. AU - Givan, S. A. AU - Yanovsky, M. AU - Hong, F. AU - Kay, S. A. AU - Chory, J. PY - 2008 DA - 2008// TI - Network discovery pipeline elucidates conserved time-of-day-specific cis-regulatory modules JO - PLoS Genet VL - 4 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pgen.0040014 DO - 10.1371/journal.pgen.0040014 ID - Michael2008 ER - TY - JOUR AU - Filichkin, S. A. AU - Breton, G. AU - Priest, H. D. AU - Dharmawardhana, P. AU - Jaiswal, P. AU - Fox, S. E. AU - Michael, T. P. AU - Chory, J. AU - Kay, S. A. AU - Mockler, T. C. PY - 2011 DA - 2011// TI - Global profiling of rice and poplar transcriptomes highlights key conserved circadian-controlled pathways and cis-regulatory modules JO - PLoS One VL - 6 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0016907 DO - 10.1371/journal.pone.0016907 ID - Filichkin2011 ER - TY - JOUR AU - Mockler, T. C. AU - Michael, T. P. AU - Priest, H. D. AU - Shen, R. AU - Sullivan, C. M. AU - Givan, S. A. AU - McEntee, C. AU - Kay, S. A. AU - Chory, J. PY - 2007 DA - 2007// TI - The diurnal project: diurnal and circadian expression profiling, model-based pattern matching, and promoter analysis JO - Cold Spring Harbor Symp Quant Biol VL - 72 UR - https://doi.org/10.1101/sqb.2007.72.006 DO - 10.1101/sqb.2007.72.006 ID - Mockler2007 ER - TY - JOUR AU - Covington, M. F. AU - Harmer, S. L. PY - 2007 DA - 2007// TI - The circadian clock regulates auxin signaling and responses in Arabidopsis JO - PLoS Biol VL - 5 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pbio.0050222 DO - 10.1371/journal.pbio.0050222 ID - Covington2007 ER - TY - JOUR AU - Nakamichi, N. AU - Kiba, T. AU - Henriques, R. AU - Mizuno, T. AU - Chua, N. H. AU - Sakakibara, H. PY - 2010 DA - 2010// TI - PSEUDO-RESPONSE REGULATORS 9, 7, and 5 are transcriptional repressors in the arabidopsis circadian clock JO - Plant Cell VL - 22 UR - https://doi.org/10.1105/tpc.109.072892 DO - 10.1105/tpc.109.072892 ID - Nakamichi2010 ER - TY - JOUR AU - Fukushima, A. AU - Kusano, M. AU - Nakamichi, N. AU - Kobayashi, M. AU - Hayashi, N. AU - Sakakibara, H. AU - Mizuno, T. AU - Saito, K. PY - 2009 DA - 2009// TI - Impact of clock-associated Arabidopsis pseudo-response regulators in metabolic coordination JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 106 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0900952106 DO - 10.1073/pnas.0900952106 ID - Fukushima2009 ER - TY - JOUR AU - Gutierrez, R. A. AU - Stokes, T. L. AU - Thum, K. AU - Xu, X. AU - Obertello, M. AU - Katari, M. S. AU - Tanurdzic, M. AU - Dean, A. AU - Nero, D. C. AU - McClung, C. R. AU - Conuzzi, G. M. PY - 2008 DA - 2008// TI - Systems approach identifies an organic nitrogen-responsive gene network that is regulated by the master clock control gene CCA1 JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 105 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0800211105 DO - 10.1073/pnas.0800211105 ID - Gutierrez2008 ER - TY - JOUR AU - Lai, A. G. AU - Doherty, C. J. AU - Mueller-Roeber, B. AU - Kay, S. A. AU - Schippers, J. H. M. AU - Dijkwel, P. P. PY - 2012 DA - 2012// TI - CIRCADIAN CLOCK-ASSOCIATED 1 regulates ROS homeostasis and oxidative stress responses JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 109 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.1209148109 DO - 10.1073/pnas.1209148109 ID - Lai2012 ER - TY - JOUR AU - Bhardwaj, V. AU - Meier, S. AU - Petersen, L. N. AU - Ingle, R. A. AU - Roden, L. C. PY - 2011 DA - 2011// TI - Defence responses of Arabidopsis thaliana to infection by Pseudomonas syringae are regulated by the circadian clock JO - PLoS One VL - 6 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0026968 DO - 10.1371/journal.pone.0026968 ID - Bhardwaj2011 ER - TY - JOUR AU - Goodspeed, D. AU - Chehab, E. W. AU - Min-Venditti, A. AU - Braam, J. AU - Covington, M. F. PY - 2012 DA - 2012// TI - Arabidopsis synchronizes jasmonate-mediated defense with insect circadian behavior JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 109 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.1116368109 DO - 10.1073/pnas.1116368109 ID - Goodspeed2012 ER - TY - JOUR AU - Shin, J. AU - Heidrich, K. AU - Sanchez-Villarreal, A. AU - Parker, J. E. AU - Davis, S. J. PY - 2012 DA - 2012// TI - TIME FOR COFFEE represses accumulation of the MYC2 transcription factor to provide time-of-day regulation of jasmonate signaling in arabidopsis JO - Plant Cell VL - 24 UR - https://doi.org/10.1105/tpc.111.095430 DO - 10.1105/tpc.111.095430 ID - Shin2012 ER - TY - JOUR AU - Wang, W. AU - Barnaby, J. Y. AU - Tada, Y. AU - Li, H. AU - Tor, M. AU - Caldelari, D. AU - Lee, D. -. u. AU - Fu, X. -. D. AU - Dong, X. PY - 2011 DA - 2011// TI - Timing of plant immune responses by a central circadian regulator JO - Nature VL - 470 UR - https://doi.org/10.1038/nature09766 DO - 10.1038/nature09766 ID - Wang2011 ER - TY - JOUR AU - Fu, Z. Q. AU - Guo, M. AU - Jeong, B. R. AU - Tian, F. AU - Elthon, T. E. AU - Cerny, R. L. AU - Staiger, D. AU - Alfano, J. R. PY - 2007 DA - 2007// TI - A type III effector ADP-ribosylates RNA-binding proteins and quells plant immunity JO - Nature VL - 447 UR - https://doi.org/10.1038/nature05737 DO - 10.1038/nature05737 ID - Fu2007 ER - TY - JOUR AU - Streitner, C. AU - Hennig, L. AU - Korneli, C. AU - Staiger, D. PY - 2010 DA - 2010// TI - Global transcript profiling of transgenic plants constitutively overexpressing the RNA-binding protein AtGRP7 JO - BMC Plant Biol VL - 10 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2229-10-221 DO - 10.1186/1471-2229-10-221 ID - Streitner2010 ER - TY - JOUR AU - Nicaise, V. AU - Joe, A. AU - Jeong, B. AU - Korneli, C. AU - Boutrot, F. AU - Wested, I. AU - Staiger, D. AU - Alfano, J. R. AU - Zipfel, C. PY - 2013 DA - 2013// TI - Pseudomonas HopU1 affects interaction of plant immune receptor mRNAs to the RNA-binding protein GRP7 JO - EMBO J VL - 32 UR - https://doi.org/10.1038/emboj.2013.15 DO - 10.1038/emboj.2013.15 ID - Nicaise2013 ER - TY - JOUR AU - McWatters, H. G. AU - Roden, L. C. AU - Staiger, D. PY - 2001 DA - 2001// TI - Picking out parallels: plant circadian clocks in context JO - Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci VL - 356 UR - https://doi.org/10.1098/rstb.2001.0936 DO - 10.1098/rstb.2001.0936 ID - McWatters2001 ER - TY - JOUR AU - James, A. B. AU - Monreal, J. A. AU - Nimmo, G. A. AU - Kelly, C. L. AU - Herzyk, P. AU - Jenkins, G. I. AU - Nimmo, H. G. PY - 2008 DA - 2008// TI - The circadian clock in Arabidopsis roots is a simplified slave version of the clock in shoots JO - Science VL - 322 UR - https://doi.org/10.1126/science.1161403 DO - 10.1126/science.1161403 ID - James2008 ER - TY - JOUR AU - Wuarin, J. AU - Falvey, E. AU - Lavery, D. AU - Talbot, D. AU - Schmidt, E. AU - Ossipow, V. AU - Fonjallaz, P. AU - Schibler, U. PY - 1992 DA - 1992// TI - The role of the transcriptional activator protein DBP in circadian liver gene expression JO - J Cell Sci VL - 16 UR - https://doi.org/10.1242/jcs.1992.Supplement_16.15 DO - 10.1242/jcs.1992.Supplement_16.15 ID - Wuarin1992 ER - TY - JOUR AU - Lidder, P. AU - Gutierrez, R. A. AU - Salome, P. A. AU - McClung, C. R. AU - Green, P. J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Circadian control of messenger RNA stability. Association with a sequence-specific messenger RNA decay pathway JO - Plant Physiol VL - 138 UR - https://doi.org/10.1104/pp.105.060368 DO - 10.1104/pp.105.060368 ID - Lidder2005 ER - TY - JOUR AU - Staiger, D. PY - 2001 DA - 2001// TI - RNA-binding proteins and circadian rhythms in Arabidopsis thaliana JO - Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci VL - 356 UR - https://doi.org/10.1098/rstb.2001.0964 DO - 10.1098/rstb.2001.0964 ID - Staiger2001 ER - TY - JOUR AU - Sanchez, S. E. AU - Petrillo, E. AU - Beckwith, E. J. AU - Zhang, X. AU - Rugnone, M. L. AU - Hernando, C. E. AU - Cuevas, J. C. AU - Godoy Herz, M. A. AU - Depetris-Chauvin, A. AU - Simpson, C. G. AU - Brown, J. W. AU - Cerdán, P. D. AU - Borevitz, J. O. AU - Mas, P. AU - Ceriani, M. F. AU - Kornblihtt, A. R. AU - Yanovsky, M. J. PY - 2010 DA - 2010// TI - A methyl transferase links the circadian clock to the regulation of alternative splicing JO - Nature VL - 468 UR - https://doi.org/10.1038/nature09470 DO - 10.1038/nature09470 ID - Sanchez2010 ER - TY - JOUR AU - Hong, S. AU - Song, H. R. AU - Lutz, K. AU - Kerstetter, R. A. AU - Michael, T. P. AU - McClung, C. R. PY - 2010 DA - 2010// TI - Type II protein arginine methyltransferase 5 (PRMT5) is required for circadian period determination in Arabidopsis thaliana JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 107 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.1011987107 DO - 10.1073/pnas.1011987107 ID - Hong2010 ER - TY - JOUR AU - Deng, X. AU - Gu, L. AU - Liu, C. AU - Lu, T. AU - Lu, F. AU - Lu, Z. AU - Cui, P. AU - Pei, Y. AU - Wang, B. AU - Hu, S. AU - Cao, C. PY - 2010 DA - 2010// TI - Arginine methylation mediated by the Arabidopsis homolog of PRMT5 is essential for proper pre-mRNA splicing JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 107 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.1009669107 DO - 10.1073/pnas.1009669107 ID - Deng2010 ER - TY - JOUR AU - Jones, M. A. AU - Williams, B. A. AU - McNicol, J. AU - Simpson, C. G. AU - Brown, J. W. S. AU - Harmer, S. L. PY - 2012 DA - 2012// TI - Mutation of arabidopsis SPLICEOSOMAL TIMEKEEPER LOCUS1 causes circadian clock defects JO - Plant Cell VL - 24 UR - https://doi.org/10.1105/tpc.112.104828 DO - 10.1105/tpc.112.104828 ID - Jones2012 ER - TY - JOUR AU - Wang, X. AU - Wu, F. AU - Xie, Q. AU - Wang, H. AU - Wang, Y. AU - Yue, Y. AU - Gahura, O. AU - Ma, S. AU - Liu, L. AU - Cao, Y. AU - Jiao, Y. AU - Puta, F. AU - McClung, C. R. AU - Xu, X. AU - Ma, L. PY - 2012 DA - 2012// TI - SKIP is a component of the spliceosome linking alternative splicing and the circadian clock in Arabidopsis JO - Plant Cell VL - 24 UR - https://doi.org/10.1105/tpc.112.100081 DO - 10.1105/tpc.112.100081 ID - Wang2012 ER - TY - JOUR AU - Streitner, C. AU - Köster, T. AU - Simpson, C. G. AU - Shaw, P. AU - Danisman, S. AU - Brown, J. W. S. AU - Staiger, D. PY - 2012 DA - 2012// TI - An hnRNP-like RNA-binding protein affects alternative splicing by in vivo interaction with target transcripts in Arabidopsis thaliana JO - Nucleic Acids Res VL - 40 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gks873 DO - 10.1093/nar/gks873 ID - Streitner2012 ER - TY - JOUR AU - Schöning, J. C. AU - Streitner, C. AU - Meyer, I. M. AU - Gao, Y. AU - Staiger, D. PY - 2008 DA - 2008// TI - Reciprocal regulation of glycine-rich RNA-binding proteins via an interlocked feedback loop coupling alternative splicing to nonsense-mediated decay in Arabidopsis JO - Nucleic Acids Res VL - 36 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkn847 DO - 10.1093/nar/gkn847 ID - Schöning2008 ER - TY - JOUR AU - Schmal, C. AU - Reimann, P. AU - Staiger, D. PY - 2013 DA - 2013// TI - A circadian clock-regulated toggle switch explains AtGRP7 and AtGRP8 oscillations in Arabidopsis thaliana JO - PLoS Comput Biol VL - 9 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002986 DO - 10.1371/journal.pcbi.1002986 ID - Schmal2013 ER - TY - JOUR AU - James, A. B. AU - Syed, N. H. AU - Bordage, S. AU - Marshall, J. AU - Nimmo, G. A. AU - Jenkins, G. I. AU - Herzyk, P. AU - Brown, J. W. S. AU - Nimmo, H. G. PY - 2012 DA - 2012// TI - Alternative splicing mediates responses of the Arabidopsis circadian clock to temperature changes JO - Plant Cell VL - 24 UR - https://doi.org/10.1105/tpc.111.093948 DO - 10.1105/tpc.111.093948 ID - James2012 ER - TY - JOUR AU - Filichkin, S. A. AU - Priest, H. D. AU - Givan, S. A. AU - Shen, R. AU - Bryant, D. W. AU - Fox, S. E. AU - Wong, W. K. AU - Mockler, T. C. PY - 2010 DA - 2010// TI - Genome-wide mapping of alternative splicing in Arabidopsis thaliana JO - Genome Res VL - 20 UR - https://doi.org/10.1101/gr.093302.109 DO - 10.1101/gr.093302.109 ID - Filichkin2010 ER - TY - JOUR AU - Hwang, H. J. AU - Cho, M. -. H. AU - Hahn, B. -. S. AU - Lim, H. AU - Kwon, Y. -. K. AU - Hahn, T. -. R. AU - Bhoo, S. H. PY - 2011 DA - 2011// TI - Proteomic identification of rhythmic proteins in rice seedlings JO - Biochim Biophys Acta VL - 1840 UR - https://doi.org/10.1016/j.bbapap.2011.01.010 DO - 10.1016/j.bbapap.2011.01.010 ID - Hwang2011 ER - TY - JOUR AU - Reddy, A. B. AU - Karp, N. A. AU - Maywood, E. S. AU - Sage, E. A. AU - Deery, M. AU - O'Neill, J. S. AU - Wong, G. K. AU - Chesham, J. AU - Odell, M. AU - Lilley, K. S. AU - Kyriacou, C. P. AU - Hastings, M. H. PY - 2006 DA - 2006// TI - Circadian orchestration of the hepatic proteome JO - Curr Biol VL - 16 UR - https://doi.org/10.1016/j.cub.2006.04.026 DO - 10.1016/j.cub.2006.04.026 ID - Reddy2006 ER - TY - JOUR AU - Chen, X. PY - 2009 DA - 2009// TI - Small RNAs and their roles in plant development JO - Annu Rev Cell Dev Biol VL - 25 UR - https://doi.org/10.1146/annurev.cellbio.042308.113417 DO - 10.1146/annurev.cellbio.042308.113417 ID - Chen2009 ER - TY - JOUR AU - Gatfield, D. AU - Le Martelot, G. AU - Vejnar, C. E. AU - Gerlach, D. AU - Schaad, O. AU - Fleury-Olela, F. AU - Ruskeepää, A. L. AU - Oresic, M. AU - Esau, C. C. AU - Zdobnov, E. M. AU - Schibler, U. PY - 2009 DA - 2009// TI - Integration of microRNA miR-122 in hepatic circadian gene expression JO - Genes Dev VL - 23 UR - https://doi.org/10.1101/gad.1781009 DO - 10.1101/gad.1781009 ID - Gatfield2009 ER - TY - JOUR AU - Alvarez-Saavedra, M. AU - Antoun, G. AU - Yanagiya, A. AU - Oliva-Hernandez, R. AU - Cornejo-Palma, D. AU - Perez-Iratxeta, C. AU - Sonenberg, N. AU - Cheng, H. Y. PY - 2011 DA - 2011// TI - miRNA-132 orchestrates chromatin remodeling and translational control of the circadian clock JO - Hum Mol Genet VL - 20 UR - https://doi.org/10.1093/hmg/ddq519 DO - 10.1093/hmg/ddq519 ID - Alvarez-Saavedra2011 ER - TY - JOUR AU - Hazen, S. P. AU - Naef, F. AU - Quisel, T. AU - Gendron, J. M. AU - Chen, H. AU - Ecker, J. R. AU - Borevitz, J. O. AU - Kay, S. A. PY - 2009 DA - 2009// TI - Exploring the transcriptional landscape of plant circadian rhythms using genome tiling arrays JO - Genome Biol VL - 10 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2009-10-2-r17 DO - 10.1186/gb-2009-10-2-r17 ID - Hazen2009 ER - TY - JOUR AU - Sire, C. AU - Moreno, A. B. AU - Garcia-Chapa, M. AU - Lopez-Moya, J. J. AU - San Segundo, B. PY - 2009 DA - 2009// TI - Diurnal oscillation in the accumulation of Arabidopsis microRNAs, miR167, miR168, miR171 and miR398 JO - FEBS Lett VL - 583 UR - https://doi.org/10.1016/j.febslet.2009.02.024 DO - 10.1016/j.febslet.2009.02.024 ID - Sire2009 ER - TY - JOUR AU - Jung, J. H. AU - Seo, Y. H. AU - Seo, P. J. AU - Reyes, J. L. AU - Yun, J. AU - Chua, N. H. AU - Park, C. M. PY - 2007 DA - 2007// TI - The GIGANTEA-regulated MicroRNA172 mediates photoperiodic flowering independent of CONSTANS in Arabidopsis JO - Plant Cell VL - 19 UR - https://doi.org/10.1105/tpc.107.054528 DO - 10.1105/tpc.107.054528 ID - Jung2007 ER - TY - JOUR AU - Kramer, C. AU - Loros, J. J. AU - Dunlap, J. C. AU - Crosthwaite, S. K. PY - 2003 DA - 2003// TI - Role for antisense RNA in regulating circadian clock function in Neurospora crassa JO - Nature VL - 421 UR - https://doi.org/10.1038/nature01427 DO - 10.1038/nature01427 ID - Kramer2003 ER - TY - JOUR AU - Hazen, S. P. AU - Schultz, T. F. AU - Pruneda-Paz, J. L. AU - Borevitz, J. O. AU - Ecker, J. R. AU - Kay, S. A. PY - 2005 DA - 2005// TI - LUX ARRHYTHMO encodes a Myb domain protein essential for circadian rhythms JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 102 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0503029102 DO - 10.1073/pnas.0503029102 ID - Hazen2005 ER - TY - JOUR AU - Somers, D. E. AU - Schultz, T. F. AU - Milnamow, M. AU - Kay, S. A. PY - 2000 DA - 2000// TI - ZEITLUPE encodes a novel clock-associated PAS protein from Arabidopsis JO - Cell VL - 101 UR - https://doi.org/10.1016/S0092-8674(00)80841-7 DO - 10.1016/S0092-8674(00)80841-7 ID - Somers2000 ER - TY - JOUR AU - Onai, K. AU - Ishiura, M. PY - 2005 DA - 2005// TI - PHYTOCLOCK 1 encoding a novel GARP protein essential for the Arabidopsis circadian clock JO - Genes Cells VL - 10 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-2443.2005.00892.x DO - 10.1111/j.1365-2443.2005.00892.x ID - Onai2005 ER - TY - JOUR AU - Millar, A. J. AU - Carre, I. A. AU - Strayer, C. A. AU - Chua, N. H. AU - Kay, S. A. PY - 1995 DA - 1995// TI - Circadian clock mutants in Arabidopsis identified by luciferase imaging JO - Science VL - 267 UR - https://doi.org/10.1126/science.7855595 DO - 10.1126/science.7855595 ID - Millar1995 ER - TY - JOUR AU - Hanano, S. AU - Stracke, R. AU - Jakoby, M. AU - Merkle, T. AU - Domagalska, M. A. AU - Weisshaar, B. AU - Davis, S. J. PY - 2008 DA - 2008// TI - A systematic survey in Arabidopsis thaliana of transcription factors that modulate circadian parameters JO - BMC Genomics VL - 9 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-9-182 DO - 10.1186/1471-2164-9-182 ID - Hanano2008 ER - TY - JOUR AU - Pruneda-Paz, J. L. AU - Breton, G. AU - Para, A. AU - Kay, S. A. PY - 2009 DA - 2009// TI - A functional genomics approach reveals CHE as a component of the Arabidopsis circadian clock JO - Science VL - 323 UR - https://doi.org/10.1126/science.1167206 DO - 10.1126/science.1167206 ID - Pruneda-Paz2009 ER - TY - JOUR AU - Huang, W. AU - Perez-Garcia, P. AU - Pokhilko, A. AU - Millar, A. J. AU - Antoshechkin, I. AU - Riechmann, J. L. AU - Mas, P. PY - 2012 DA - 2012// TI - Mapping the core of the Arabidopsis circadian clock defines the network structure of the oscillator JO - Science VL - 336 UR - https://doi.org/10.1126/science.1219075 DO - 10.1126/science.1219075 ID - Huang2012 ER - TY - JOUR AU - Gendron, J. M. AU - Pruneda-Paz, J. L. AU - Doherty, C. J. AU - Gross, A. M. AU - Kang, S. E. AU - Kay, S. A. PY - 2012 DA - 2012// TI - Arabidopsis circadian clock protein, TOC1, is a DNA-binding transcription factor JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 109 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.1200355109 DO - 10.1073/pnas.1200355109 ID - Gendron2012 ER - TY - JOUR AU - Nakamichi, N. AU - Kiba, T. AU - Kamioka, M. AU - Suzuki, T. AU - Yamashino, T. AU - Higashiyama, T. AU - Sakakibara, H. AU - Mizuno, T. PY - 2012 DA - 2012// TI - Transcriptional repressor PRR5 directly regulates clock-output pathways JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 109 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.1205156109 DO - 10.1073/pnas.1205156109 ID - Nakamichi2012 ER - TY - JOUR AU - Michael, T. P. AU - McClung, C. R. PY - 2003 DA - 2003// TI - Enhancer trapping reveals widespread circadian clock transcriptional control in arabidopsis JO - Plant Physiol VL - 132 UR - https://doi.org/10.1104/pp.021006 DO - 10.1104/pp.021006 ID - Michael2003 ER - TY - JOUR AU - Doi, M. AU - Hirayama, J. AU - Sassone-Corsi, P. PY - 2006 DA - 2006// TI - Circadian regulator CLOCK is a histone acetyltransferase JO - Cell VL - 125 UR - https://doi.org/10.1016/j.cell.2006.03.033 DO - 10.1016/j.cell.2006.03.033 ID - Doi2006 ER - TY - JOUR AU - Perales, M. AU - Mas, P. PY - 2007 DA - 2007// TI - A functional link between rhythmic changes in chromatin structure and the Arabidopsis biological clock JO - Plant Cell VL - 19 UR - https://doi.org/10.1105/tpc.107.050807 DO - 10.1105/tpc.107.050807 ID - Perales2007 ER - TY - JOUR AU - Song, H. -. R. AU - Noh, Y. -. S. PY - 2012 DA - 2012// TI - Rhythmic oscillation of histone acetylation and methylation at the Arabidopsis central clock loci JO - Mol Cells VL - 34 UR - https://doi.org/10.1007/s10059-012-0103-5 DO - 10.1007/s10059-012-0103-5 ID - Song2012 ER - TY - JOUR AU - Malapeira, J. AU - Khaitova, L. C. AU - Mas, P. PY - 2012 DA - 2012// TI - Ordered changes in histone modifications at the core of the Arabidopsis circadian clock JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 109 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.1217022110 DO - 10.1073/pnas.1217022110 ID - Malapeira2012 ER - TY - JOUR AU - Farinas, B. AU - Mas, P. PY - 2011 DA - 2011// TI - Functional implication of the MYB transcription factor RVE8/LCL5 in the circadian control of histone acetylation JO - Plant J VL - 66 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-313X.2011.04484.x DO - 10.1111/j.1365-313X.2011.04484.x ID - Farinas2011 ER - TY - JOUR AU - Liu, C. AU - Lu, F. AU - Cui, X. AU - Cao, X. PY - 2010 DA - 2010// TI - Histone methylation in higher plants JO - Annu Rev Plant Biol VL - 61 UR - https://doi.org/10.1146/annurev.arplant.043008.091939 DO - 10.1146/annurev.arplant.043008.091939 ID - Liu2010 ER - TY - JOUR AU - Corellou, F. AU - Schwartz, C. AU - Motta, J. P. AU - Djouani-Tahri, E. B. AU - Sanchez, F. AU - Bouget, F. Y. PY - 2009 DA - 2009// TI - Clocks in the green lineage: comparative functional analysis of the circadian architecture of the picoeukaryote Ostreococcus JO - Plant Cell VL - 21 UR - https://doi.org/10.1105/tpc.109.068825 DO - 10.1105/tpc.109.068825 ID - Corellou2009 ER - TY - JOUR AU - Turner, A. AU - Beales, J. AU - Faure, S. AU - Dunford, R. P. AU - Laurie, D. A. PY - 2005 DA - 2005// TI - The pseudo-response regulator Ppd-H1 provides adaptation to photoperiod in barley JO - Science VL - 310 UR - https://doi.org/10.1126/science.1117619 DO - 10.1126/science.1117619 ID - Turner2005 ER - TY - JOUR AU - Shaw, L. M. AU - Turner, A. S. AU - Laurie, D. A. PY - 2012 DA - 2012// TI - The impact of photoperiod insensitive Ppd-1a mutations on the photoperiod pathway across the three genomes of hexaploid wheat (Triticum aestivum) JO - Plant J VL - 71 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-313X.2012.04971.x DO - 10.1111/j.1365-313X.2012.04971.x ID - Shaw2012 ER - TY - JOUR AU - Pin, P. A. AU - Zhang, W. AU - Vogt, S. H. AU - Dally, N. AU - Büttner, B. AU - Schulze-Buxloh, G. AU - Jelly, N. S. AU - Chia, T. Y. AU - Mutasa-Göttgens, E. S. AU - Dohm, J. C. AU - Himmelbauer, H. AU - Weisshaar, B. AU - Kraus, J. AU - Gielen, J. J. AU - Lommel, M. AU - Weyens, G. AU - Wahl, B. AU - Schechert, A. AU - Nilsson, O. AU - Jung, C. AU - Kraft, T. AU - Müller, A. E. PY - 2012 DA - 2012// TI - The role of a pseudo-response regulator gene in life cycle adaptation and domestication of beet JO - Curr Biol VL - 22 UR - https://doi.org/10.1016/j.cub.2012.04.007 DO - 10.1016/j.cub.2012.04.007 ID - Pin2012 ER - TY - JOUR AU - Faure, S. AU - Turner, A. S. AU - Gruszka, D. AU - Christodoulou, V. AU - Davis, S. J. AU - von Korff, M. AU - Laurie, D. A. PY - 2012 DA - 2012// TI - Mutation at the circadian clock gene EARLY MATURITY 8 adapts domesticated barley (Hordeum vulgare) to short growing seasons JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 109 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.1120496109 DO - 10.1073/pnas.1120496109 ID - Faure2012 ER - TY - JOUR AU - Weller, J. L. AU - Liew, L. C. AU - Hecht, V. F. AU - Rajandran, V. AU - Laurie, R. E. AU - Ridge, S. AU - Wenden, B. AU - Vander Schoor, J. K. AU - Jaminon, O. AU - Blassiau, C. AU - Dalmais, M. AU - Rameau, C. AU - Bendahmane, A. AU - Macknight, R. C. AU - Lejeune-Hénaut, I. PY - 2012 DA - 2012// TI - A conserved molecular basis for photoperiod adaptation in two temperate legumes JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 109 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.1207943110 DO - 10.1073/pnas.1207943110 ID - Weller2012 ER - TY - JOUR AU - Matsubara, K. AU - Ogiso-Tanaka, E. AU - Hori, K. AU - Ebana, K. AU - Ando, T. AU - Yano, M. PY - 2012 DA - 2012// TI - Natural variation in Hd17, a homolog of Arabidopsis ELF3 that is involved in rice photoperiodic flowering JO - Plant Cell Physiol VL - 53 UR - https://doi.org/10.1093/pcp/pcs028 DO - 10.1093/pcp/pcs028 ID - Matsubara2012 ER - TY - JOUR AU - Higgins, J. A. AU - Bailey, P. C. AU - Laurie, D. A. PY - 2010 DA - 2010// TI - Comparative genomics of flowering time pathways using Brachypodium distachyon as a model for the temperate grasses JO - PLoS One VL - 5 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0010065 DO - 10.1371/journal.pone.0010065 ID - Higgins2010 ER - TY - JOUR AU - Meyers, L. A. AU - Levin, D. A. PY - 2006 DA - 2006// TI - On the abundance of polyploids in flowering plants JO - Evolution VL - 60 UR - https://doi.org/10.1111/j.0014-3820.2006.tb01198.x DO - 10.1111/j.0014-3820.2006.tb01198.x ID - Meyers2006 ER - TY - JOUR AU - Lou, P. AU - Wu, J. AU - Cheng, F. AU - Cressman, L. G. AU - Wang, X. AU - McClung, C. R. PY - 2012 DA - 2012// TI - Preferential retention of circadian clock genes during diploidization following whole genome triplication in Brassica rapa JO - Plant Cell VL - 24 UR - https://doi.org/10.1105/tpc.112.099499 DO - 10.1105/tpc.112.099499 ID - Lou2012 ER - TY - JOUR AU - Lou, P. AU - Xie, Q. AU - Xu, X. AU - Edwards, C. E. AU - Brock, M. T. AU - Weinig, C. AU - McClung, C. R. PY - 2011 DA - 2011// TI - Genetic architecture of the circadian clock and flowering time in Brassica rapa JO - Theor Appl Genet VL - 123 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-011-1592-x DO - 10.1007/s00122-011-1592-x ID - Lou2011 ER - TY - JOUR AU - Ni, Z. AU - Kim, E. D. AU - Ha, M. AU - Lackey, E. AU - Liu, J. AU - Zhang, Y. AU - Sun, Q. AU - Chen, Z. J. PY - 2008 DA - 2008// TI - Altered circadian rhythms regulate growth vigour in hybrids and allopolyploids JO - Nature VL - 457 UR - https://doi.org/10.1038/nature07523 DO - 10.1038/nature07523 ID - Ni2008 ER - TY - JOUR AU - Kim, E. -. D. AU - Chen, Z. J. PY - 2012 DA - 2012// TI - Unstable transcripts in Arabidopsis allotetraploids are associated with nonadditive gene expression in response to abiotic and biotic stresses JO - PLoS One VL - 6 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0024251 DO - 10.1371/journal.pone.0024251 ID - Kim2012 ER -