TY - JOUR AU - Dai, H. AU - van't Veer, L. AU - Lamb, J. AU - He, Y. D. AU - Mao, M. AU - Fine, B. M. AU - Bernards, R. AU - van de Vijver, M. AU - Deutsch, P. AU - Sachs, A. AU - Stoughton, R. AU - Friend, S. PY - 2005 DA - 2005// TI - A cell proliferation signature is a marker of extremely poor outcome in a subpopulation of breast cancer patients JO - Cancer Res VL - 65 UR - https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-04-3953 DO - 10.1158/0008-5472.CAN-04-3953 ID - Dai2005 ER - TY - JOUR AU - Ivshina, A. V. AU - George, J. AU - Senko, O. AU - Mow, B. AU - Putti, T. C. AU - Smeds, J. AU - Lindahl, T. AU - Pawitan, Y. AU - Hall, P. AU - Nordgren, H. AU - Wong, J. E. AU - Liu, E. T. AU - Bergh, J. AU - Kuznetsov, V. A. AU - Miller, L. D. PY - 2006 DA - 2006// TI - Genetic reclassification of histologic grade delineates new clinical subtypes of breast cancer JO - Cancer Res VL - 66 UR - https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-05-4414 DO - 10.1158/0008-5472.CAN-05-4414 ID - Ivshina2006 ER - TY - JOUR AU - Miller, L. D. AU - Smeds, J. AU - George, J. AU - Vega, V. B. AU - Vergara, L. AU - Ploner, A. AU - Pawitan, Y. AU - Hall, P. AU - Klaar, S. AU - Liu, E. T. AU - Bergh, J. PY - 2005 DA - 2005// TI - An expression signature for p53 status in human breast cancer predicts mutation status, transcriptional effects, and patient survival JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 102 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0506230102 DO - 10.1073/pnas.0506230102 ID - Miller2005 ER - TY - JOUR AU - Rosenwald, A. AU - Wright, G. AU - Wiestner, A. AU - Chan, W. C. AU - Connors, J. M. AU - Campo, E. AU - Gascoyne, R. D. AU - Grogan, T. M. AU - Muller-Hermelink, H. K. AU - Smeland, E. B. AU - Chiorazzi, M. AU - Giltnane, J. M. AU - Hurt, E. M. AU - Zhao, H. AU - Averett, L. AU - Henrickson, S. AU - Yang, L. AU - Powell, J. AU - Wilson, W. H. AU - Jaffe, E. S. AU - Simon, R. AU - Klausner, R. D. AU - Montserrat, E. AU - Bosch, F. AU - Greiner, T. C. AU - Weisenburger, D. D. AU - Sanger, W. G. AU - Dave, B. J. AU - Lynch, J. C. AU - Vose, J. PY - 2003 DA - 2003// TI - The proliferation gene expression signature is a quantitative integrator of oncogenic events that predicts survival in mantle cell lymphoma JO - Cancer Cell VL - 3 UR - https://doi.org/10.1016/S1535-6108(03)00028-X DO - 10.1016/S1535-6108(03)00028-X ID - Rosenwald2003 ER - TY - JOUR AU - Sotiriou, C. AU - Wirapati, P. AU - Loi, S. AU - Harris, A. AU - Fox, S. AU - Smeds, J. AU - Nordgren, H. AU - Farmer, P. AU - Praz, V. AU - Haibe-Kains, B. AU - Desmedt, C. AU - Larsimont, D. AU - Cardoso, F. AU - Peterse, H. AU - Nuyten, D. AU - Buyse, M. AU - Van de Vijver, M. J. AU - Bergh, J. AU - Piccart, M. AU - Delorenzi, M. PY - 2006 DA - 2006// TI - Gene expression profiling in breast cancer: understanding the molecular basis of histologic grade to improve prognosis JO - J Natl Cancer Inst VL - 98 UR - https://doi.org/10.1093/jnci/djj052 DO - 10.1093/jnci/djj052 ID - Sotiriou2006 ER - TY - JOUR AU - Whitfield, M. L. AU - George, L. K. AU - Grant, G. D. AU - Perou, C. M. PY - 2006 DA - 2006// TI - Common markers of proliferation JO - Nat Rev Cancer VL - 6 UR - https://doi.org/10.1038/nrc1802 DO - 10.1038/nrc1802 ID - Whitfield2006 ER - TY - JOUR AU - Whitfield, M. L. AU - Sherlock, G. AU - Saldanha, A. J. AU - Murray, J. I. AU - Ball, C. A. AU - Alexander, K. E. AU - Matese, J. C. AU - Perou, C. M. AU - Hurt, M. M. AU - Brown, P. O. AU - Botstein, D. PY - 2002 DA - 2002// TI - Identification of genes periodically expressed in the human cell cycle and their expression in tumors JO - Mol Biol Cell VL - 13 UR - https://doi.org/10.1091/mbc.02-02-0030. DO - 10.1091/mbc.02-02-0030. ID - Whitfield2002 ER - TY - JOUR AU - Hanahan, D. AU - Weinberg, R. A. PY - 2000 DA - 2000// TI - The hallmarks of cancer JO - Cell VL - 100 UR - https://doi.org/10.1016/S0092-8674(00)81683-9 DO - 10.1016/S0092-8674(00)81683-9 ID - Hanahan2000 ER - TY - JOUR AU - Hanahan, D. AU - Weinberg, R. A. PY - 2011 DA - 2011// TI - Hallmarks of cancer: the next generation JO - Cell VL - 144 UR - https://doi.org/10.1016/j.cell.2011.02.013 DO - 10.1016/j.cell.2011.02.013 ID - Hanahan2011 ER - TY - JOUR AU - Paik, S. AU - Shak, S. AU - Tang, G. AU - Kim, C. AU - Baker, J. AU - Cronin, M. AU - Baehner, F. L. AU - Walker, M. G. AU - Watson, D. AU - Park, T. AU - Hiller, W. AU - Fisher, E. R. AU - Wickerham, D. L. AU - Bryant, J. AU - Wolmark, N. PY - 2004 DA - 2004// TI - A multigene assay to predict recurrence of tamoxifen-treated, node-negative breast cancer JO - N Engl J Med VL - 351 UR - https://doi.org/10.1056/NEJMoa041588 DO - 10.1056/NEJMoa041588 ID - Paik2004 ER - TY - JOUR AU - Paik, S. AU - Tang, G. AU - Shak, S. AU - Kim, C. AU - Baker, J. AU - Kim, W. AU - Cronin, M. AU - Baehner, F. L. AU - Watson, D. AU - Bryant, J. AU - Costantino, J. P. AU - Geyer, C. E. AU - Wickerham, D. L. AU - Wolmark, N. PY - 2006 DA - 2006// TI - Gene expression and benefit of chemotherapy in women with node-negative, estrogen receptor-positive breast cancer JO - J Clin Oncol VL - 24 UR - https://doi.org/10.1200/JCO.2005.04.7985 DO - 10.1200/JCO.2005.04.7985 ID - Paik2006 ER - TY - JOUR AU - Sole, X. AU - Bonifaci, N. AU - Lopez-Bigas, N. AU - Berenguer, A. AU - Hernandez, P. AU - Reina, O. AU - Maxwell, C. A. AU - Aguilar, H. AU - Urruticoechea, A. AU - de Sanjose, S. AU - Comellas, F. AU - Capella, G. AU - Moreno, V. AU - Pujana, M. A. PY - 2009 DA - 2009// TI - Biological convergence of cancer signatures JO - PLoS One VL - 4 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0004544 DO - 10.1371/journal.pone.0004544 ID - Sole2009 ER - TY - JOUR AU - Venet, D. AU - Dumont, J. E. AU - Detours, V. PY - 2011 DA - 2011// TI - Most random gene expression signatures are significantly associated with breast cancer outcome JO - PLoS Comput Biol VL - 7 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002240 DO - 10.1371/journal.pcbi.1002240 ID - Venet2011 ER - TY - JOUR AU - Wirapati, P. AU - Sotiriou, C. AU - Kunkel, S. AU - Farmer, P. AU - Pradervand, S. AU - Haibe-Kains, B. AU - Desmedt, C. AU - Ignatiadis, M. AU - Sengstag, T. AU - Schutz, F. AU - Goldstein, D. R. AU - Piccart, M. AU - Delorenzi, M. PY - 2008 DA - 2008// TI - Meta-analysis of gene expression profiles in breast cancer: toward a unified understanding of breast cancer subtyping and prognosis signatures JO - Breast Cancer Res VL - 10 UR - https://doi.org/10.1186/bcr2124 DO - 10.1186/bcr2124 ID - Wirapati2008 ER - TY - JOUR AU - Alexe, G. AU - Dalgin, G. S. AU - Scanfeld, D. AU - Tamayo, P. AU - Mesirov, J. P. AU - DeLisi, C. AU - Harris, L. AU - Barnard, N. AU - Martel, M. AU - Levine, A. J. AU - Ganesan, S. AU - Bhanot, G. PY - 2007 DA - 2007// TI - High expression of lymphocyte-associated genes in node-negative HER2+ breast cancers correlates with lower recurrence rates JO - Cancer Res VL - 67 UR - https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-07-0539 DO - 10.1158/0008-5472.CAN-07-0539 ID - Alexe2007 ER - TY - JOUR AU - Broet, P. AU - Kuznetsov, V. A. AU - Bergh, J. AU - Liu, E. T. AU - Miller, L. D. PY - 2006 DA - 2006// TI - Identifying gene expression changes in breast cancer that distinguish early and late relapse among uncured patients JO - Bioinformatics VL - 22 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btl110 DO - 10.1093/bioinformatics/btl110 ID - Broet2006 ER - TY - JOUR AU - Rody, A. AU - Holtrich, U. AU - Pusztai, L. AU - Liedtke, C. AU - Gaetje, R. AU - Ruckhaeberle, E. AU - Solbach, C. AU - Hanker, L. AU - Ahr, A. AU - Metzler, D. AU - Engels, K. AU - Karn, T. AU - Kaufmann, M. PY - 2009 DA - 2009// TI - T-cell metagene predicts a favorable prognosis in estrogen receptor-negative and HER2-positive breast cancers JO - Breast Cancer Res VL - 11 UR - https://doi.org/10.1186/bcr2234 DO - 10.1186/bcr2234 ID - Rody2009 ER - TY - JOUR AU - Schmidt, M. AU - Bohm, D. AU - von Torne, C. AU - Steiner, E. AU - Puhl, A. AU - Pilch, H. AU - Lehr, H. A. AU - Hengstler, J. G. AU - Kolbl, H. AU - Gehrmann, M. PY - 2008 DA - 2008// TI - The humoral immune system has a key prognostic impact in node-negative breast cancer JO - Cancer Res VL - 68 UR - https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-07-5206 DO - 10.1158/0008-5472.CAN-07-5206 ID - Schmidt2008 ER - TY - JOUR AU - Teschendorff, A. E. AU - Miremadi, A. AU - Pinder, S. E. AU - Ellis, I. O. AU - Caldas, C. PY - 2007 DA - 2007// TI - An immune response gene expression module identifies a good prognosis subtype in estrogen receptor negative breast cancer JO - Genome Biol VL - 8 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2007-8-8-r157 DO - 10.1186/gb-2007-8-8-r157 ID - Teschendorff2007 ER - TY - JOUR AU - Aaltomaa, S. AU - Lipponen, P. AU - Eskelinen, M. AU - Kosma, V. M. AU - Marin, S. AU - Alhava, E. AU - Syrjanen, K. PY - 1992 DA - 1992// TI - Lymphocyte infiltrates as a prognostic variable in female breast cancer JO - Eur J Cancer VL - 28A UR - https://doi.org/10.1016/0959-8049(92)90134-N DO - 10.1016/0959-8049(92)90134-N ID - Aaltomaa1992 ER - TY - JOUR AU - Cutler, S. J. AU - Black, M. M. AU - Mork, T. AU - Harvei, S. AU - Freeman, C. PY - 1969 DA - 1969// TI - Further observations on prognostic factors in cancer of the female breast JO - Cancer VL - 24 UR - https://doi.org/3.0.CO;2-B DO - 3.0.CO;2-B ID - Cutler1969 ER - TY - JOUR AU - Mahmoud, S. M. AU - Paish, E. C. AU - Powe, D. G. AU - Macmillan, R. D. AU - Grainge, M. J. AU - Lee, A. H. AU - Ellis, I. O. AU - Green, A. R. PY - 2011 DA - 2011// TI - Tumor-infiltrating CD8+ lymphocytes predict clinical outcome in breast cancer JO - J Clin Oncol VL - 29 UR - https://doi.org/10.1200/JCO.2010.30.5037 DO - 10.1200/JCO.2010.30.5037 ID - Mahmoud2011 ER - TY - JOUR AU - Ma, X. J. AU - Salunga, R. AU - Tuggle, J. T. AU - Gaudet, J. AU - Enright, E. AU - McQuary, P. AU - Payette, T. AU - Pistone, M. AU - Stecker, K. AU - Zhang, B. M. AU - Zhou, Y. X. AU - Varnholt, H. AU - Smith, B. AU - Gadd, M. AU - Chatfield, E. AU - Kessler, J. AU - Baer, T. M. AU - Erlander, M. G. AU - Sgroi, D. C. PY - 2003 DA - 2003// TI - Gene expression profiles of human breast cancer progression JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 100 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0931261100 DO - 10.1073/pnas.0931261100 ID - Ma2003 ER - TY - JOUR AU - Alizadeh, A. A. AU - Eisen, M. B. AU - Davis, R. E. AU - Ma, C. AU - Lossos, I. S. AU - Rosenwald, A. AU - Boldrick, J. C. AU - Sabet, H. AU - Tran, T. AU - Yu, X. AU - Powell, J. I. AU - Yang, L. AU - Marti, G. E. AU - Moore, T. AU - Hudson, J. AU - Lu, L. AU - Lewis, D. B. AU - Tibshirani, R. AU - Sherlock, G. AU - Chan, W. C. AU - Greiner, T. C. AU - Weisenburger, D. D. AU - Armitage, J. O. AU - Warnke, R. AU - Levy, R. AU - Wilson, W. AU - Grever, M. R. AU - Byrd, J. C. AU - Botstein, D. AU - Brown, P. O. PY - 2000 DA - 2000// TI - Distinct types of diffuse large B-cell lymphoma identified by gene expression profiling JO - Nature VL - 403 UR - https://doi.org/10.1038/35000501 DO - 10.1038/35000501 ID - Alizadeh2000 ER - TY - JOUR AU - Staudt, L. M. AU - Dave, S. PY - 2005 DA - 2005// TI - The biology of human lymphoid malignancies revealed by gene expression profiling JO - Adv Immunol VL - 87 UR - https://doi.org/10.1016/S0065-2776(05)87005-1 DO - 10.1016/S0065-2776(05)87005-1 ID - Staudt2005 ER - TY - JOUR AU - Abbas, A. R. AU - Baldwin, D. AU - Ma, Y. AU - Ouyang, W. AU - Gurney, A. AU - Martin, F. AU - Fong, S. AU - van Lookeren Campagne, M. AU - Godowski, P. AU - Williams, P. M. AU - Chan, A. C. AU - Clark, H. F. PY - 2005 DA - 2005// TI - Immune response in silico (IRIS): immune-specific genes identified from a compendium of microarray expression data JO - Genes Immun VL - 6 UR - https://doi.org/10.1038/sj.gene.6364173 DO - 10.1038/sj.gene.6364173 ID - Abbas2005 ER - TY - JOUR AU - Huang da, W. AU - Sherman, B. T. AU - Tan, Q. AU - Kir, J. AU - Liu, D. AU - Bryant, D. AU - Guo, Y. AU - Stephens, R. AU - Baseler, M. W. AU - Lane, H. C. AU - Lempicki, R. A. PY - 2007 DA - 2007// TI - DAVID Bioinformatics Resources: expanded annotation database and novel algorithms to better extract biology from large gene lists JO - Nucleic Acids Res VL - 35 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkm415 DO - 10.1093/nar/gkm415 ID - Huang da2007 ER - TY - JOUR AU - Dave, S. S. AU - Wright, G. AU - Tan, B. AU - Rosenwald, A. AU - Gascoyne, R. D. AU - Chan, W. C. AU - Fisher, R. I. AU - Braziel, R. M. AU - Rimsza, L. M. AU - Grogan, T. M. AU - Miller, T. P. AU - LeBlanc, M. AU - Greiner, T. C. AU - Weisenburger, D. D. AU - Lynch, J. C. AU - Vose, J. AU - Armitage, J. O. AU - Smeland, E. B. AU - Kvaloy, S. AU - Holte, H. AU - Delabie, J. AU - Connors, J. M. AU - Lansdorp, P. M. AU - Ouyang, Q. AU - Lister, T. A. AU - Davies, A. J. AU - Norton, A. J. AU - Muller-Hermelink, H. K. AU - Ott, G. AU - Campo, E. PY - 2004 DA - 2004// TI - Prediction of survival in follicular lymphoma based on molecular features of tumor-infiltrating immune cells JO - N Engl J Med VL - 351 UR - https://doi.org/10.1056/NEJMoa041869 DO - 10.1056/NEJMoa041869 ID - Dave2004 ER - TY - JOUR AU - Buyse, M. AU - Loi, S. AU - van't Veer, L. AU - Viale, G. AU - Delorenzi, M. AU - Glas, A. M. AU - d'Assignies, M. S. AU - Bergh, J. AU - Lidereau, R. AU - Ellis, P. AU - Harris, A. AU - Bogaerts, J. AU - Therasse, P. AU - Floore, A. AU - Amakrane, M. AU - Piette, F. AU - Rutgers, E. AU - Sotiriou, C. AU - Cardoso, F. AU - Piccart, M. J. PY - 2006 DA - 2006// TI - Validation and clinical utility of a 70-gene prognostic signature for women with node-negative breast cancer JO - J Natl Cancer Inst VL - 98 UR - https://doi.org/10.1093/jnci/djj329 DO - 10.1093/jnci/djj329 ID - Buyse2006 ER - TY - JOUR AU - Rody, A. AU - Karn, T. AU - Liedtke, C. AU - Pusztai, L. AU - Ruckhaeberle, E. AU - Hanker, L. AU - Gaetje, R. AU - Solbach, C. AU - Ahr, A. AU - Metzler, D. AU - Schmidt, M. AU - Muller, V. AU - Holtrich, U. AU - Kaufmann, M. PY - 2011 DA - 2011// TI - A clinically relevant gene signature in triple negative and basal-like breast cancer JO - Breast Cancer Res VL - 13 UR - https://doi.org/10.1186/bcr3035 DO - 10.1186/bcr3035 ID - Rody2011 ER - TY - JOUR AU - Sorlie, T. AU - Perou, C. M. AU - Tibshirani, R. AU - Aas, T. AU - Geisler, S. AU - Johnsen, H. AU - Hastie, T. AU - Eisen, M. B. AU - van de Rijn, M. AU - Jeffrey, S. S. AU - Thorsen, T. AU - Quist, H. AU - Matese, J. C. AU - Brown, P. O. AU - Botstein, D. AU - Eystein Lonning, P. AU - Borresen-Dale, A. L. PY - 2001 DA - 2001// TI - Gene expression patterns of breast carcinomas distinguish tumor subclasses with clinical implications JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 98 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.191367098 DO - 10.1073/pnas.191367098 ID - Sorlie2001 ER - TY - JOUR AU - Bianchini, G. AU - Qi, Y. AU - Alvarez, R. H. AU - Iwamoto, T. AU - Coutant, C. AU - Ibrahim, N. K. AU - Valero, V. AU - Cristofanilli, M. AU - Green, M. C. AU - Radvanyi, L. AU - Hatzis, C. AU - Hortobagyi, G. N. AU - Andre, F. AU - Gianni, L. AU - Symmans, W. F. AU - Pusztai, L. PY - 2010 DA - 2010// TI - Molecular anatomy of breast cancer stroma and its prognostic value in estrogen receptor-positive and -negative cancers JO - J Clin Oncol VL - 28 UR - https://doi.org/10.1200/JCO.2009.27.2419 DO - 10.1200/JCO.2009.27.2419 ID - Bianchini2010 ER - TY - JOUR AU - Teschendorff, A. E. AU - Gomez, S. AU - Arenas, A. AU - El-Ashry, D. AU - Schmidt, M. AU - Gehrmann, M. AU - Caldas, C. PY - 2010 DA - 2010// TI - Improved prognostic classification of breast cancer defined by antagonistic activation patterns of immune response pathway modules JO - BMC Cancer VL - 10 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2407-10-604 DO - 10.1186/1471-2407-10-604 ID - Teschendorff2010 ER - TY - JOUR AU - Perou, C. M. PY - 2010 DA - 2010// TI - Molecular stratification of triple-negative breast cancers JO - Oncologist VL - 16 ID - Perou2010 ER - TY - JOUR AU - Prat, A. AU - Parker, J. S. AU - Karginova, O. AU - Fan, C. AU - Livasy, C. AU - Herschkowitz, J. I. AU - He, X. AU - Perou, C. M. PY - 2010 DA - 2010// TI - Phenotypic and molecular characterization of the claudin-low intrinsic subtype of breast cancer JO - Breast Cancer Res VL - 12 UR - https://doi.org/10.1186/bcr2635 DO - 10.1186/bcr2635 ID - Prat2010 ER - TY - JOUR AU - Fridman, W. H. AU - Pages, F. AU - Sautes-Fridman, C. AU - Galon, J. PY - 2011 DA - 2011// TI - The immune contexture in human tumours: impact on clinical outcome JO - Nat Rev Cancer VL - 12 UR - https://doi.org/10.1038/nrc3245 DO - 10.1038/nrc3245 ID - Fridman2011 ER - TY - JOUR AU - Galon, J. AU - Fridman, W. H. AU - Pages, F. PY - 2007 DA - 2007// TI - The adaptive immunologic microenvironment in colorectal cancer: a novel perspective JO - Cancer Res VL - 67 UR - https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-06-4806 DO - 10.1158/0008-5472.CAN-06-4806 ID - Galon2007 ER - TY - JOUR AU - Clemente, C. G. AU - Mihm, M. C. AU - Bufalino, R. AU - Zurrida, S. AU - Collini, P. AU - Cascinelli, N. PY - 1996 DA - 1996// TI - Prognostic value of tumor infiltrating lymphocytes in the vertical growth phase of primary cutaneous melanoma JO - Cancer VL - 77 UR - https://doi.org/3.0.CO;2-5 DO - 3.0.CO;2-5 ID - Clemente1996 ER - TY - JOUR AU - Tefany, F. J. AU - Barnetson, R. S. AU - Halliday, G. M. AU - McCarthy, S. W. AU - McCarthy, W. H. PY - 1991 DA - 1991// TI - Immunocytochemical analysis of the cellular infiltrate in primary regressing and non-regressing malignant melanoma JO - J Invest Dermatol VL - 97 UR - https://doi.org/10.1111/1523-1747.ep12479662 DO - 10.1111/1523-1747.ep12479662 ID - Tefany1991 ER - TY - JOUR AU - Sato, E. AU - Olson, S. H. AU - Ahn, J. AU - Bundy, B. AU - Nishikawa, H. AU - Qian, F. AU - Jungbluth, A. A. AU - Frosina, D. AU - Gnjatic, S. AU - Ambrosone, C. AU - Kepner, J. AU - Odunsi, T. AU - Ritter, G. AU - Lele, S. AU - Chen, Y. T. AU - Ohtani, H. AU - Old, L. J. AU - Odunsi, K. PY - 2005 DA - 2005// TI - Intraepithelial CD8+ tumor-infiltrating lymphocytes and a high CD8+/regulatory T cell ratio are associated with favorable prognosis in ovarian cancer JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 102 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0509182102 DO - 10.1073/pnas.0509182102 ID - Sato2005 ER - TY - JOUR AU - Zhang, L. AU - Conejo-Garcia, J. R. AU - Katsaros, D. AU - Gimotty, P. A. AU - Massobrio, M. AU - Regnani, G. AU - Makrigiannakis, A. AU - Gray, H. AU - Schlienger, K. AU - Liebman, M. N. AU - Rubin, S. C. AU - Coukos, G. PY - 2003 DA - 2003// TI - Intratumoral T cells, recurrence, and survival in epithelial ovarian cancer JO - N Engl J Med VL - 348 UR - https://doi.org/10.1056/NEJMoa020177 DO - 10.1056/NEJMoa020177 ID - Zhang2003 ER - TY - JOUR AU - Baier, P. K. AU - Wimmenauer, S. AU - Hirsch, T. AU - von Specht, B. U. AU - von Kleist, S. AU - Keller, H. AU - Farthmann, E. H. PY - 1998 DA - 1998// TI - Analysis of the T cell receptor variability of tumor-infiltrating lymphocytes in colorectal carcinomas JO - Tumour Biol VL - 19 UR - https://doi.org/10.1159/000030008 DO - 10.1159/000030008 ID - Baier1998 ER - TY - JOUR AU - Galon, J. AU - Costes, A. AU - Sanchez-Cabo, F. AU - Kirilovsky, A. AU - Mlecnik, B. AU - Lagorce-Pages, C. AU - Tosolini, M. AU - Camus, M. AU - Berger, A. AU - Wind, P. AU - Zinzindohoue, F. AU - Bruneval, P. AU - Cugnenc, P. H. AU - Trajanoski, Z. AU - Fridman, W. H. AU - Pages, F. PY - 2006 DA - 2006// TI - Type, density, and location of immune cells within human colorectal tumors predict clinical outcome JO - Science VL - 313 UR - https://doi.org/10.1126/science.1129139 DO - 10.1126/science.1129139 ID - Galon2006 ER - TY - JOUR AU - Galon, J. AU - Pages, F. AU - Marincola, F. M. AU - Angell, H. K. AU - Thurin, M. AU - Lugli, A. AU - Zlobec, I. AU - Berger, A. AU - Bifulco, C. AU - Botti, G. AU - Tatangelo, F. AU - Britten, C. M. AU - Kreiter, S. AU - Chouchane, L. AU - Delrio, P. AU - Arndt, H. AU - Asslaber, M. AU - Maio, M. AU - Masucci, G. V. AU - Mihm, M. AU - Vidal-Vanaclocha, F. AU - Allison, J. P. AU - Gnjatic, S. AU - Hakansson, L. AU - Huber, C. AU - Singh-Jasuja, H. AU - Ottensmeier, C. AU - Zwierzina, H. AU - Laghi, L. AU - Grizzi, F. PY - 2012 DA - 2012// TI - Cancer classification using the Immunoscore: a worldwide task force JO - J Transl Med VL - 10 UR - https://doi.org/10.1186/1479-5876-10-205 DO - 10.1186/1479-5876-10-205 ID - Galon2012 ER - TY - JOUR AU - Pages, F. AU - Berger, A. AU - Camus, M. AU - Sanchez-Cabo, F. AU - Costes, A. AU - Molidor, R. AU - Mlecnik, B. AU - Kirilovsky, A. AU - Nilsson, M. AU - Damotte, D. AU - Meatchi, T. AU - Bruneval, P. AU - Cugnenc, P. H. AU - Trajanoski, Z. AU - Fridman, W. H. AU - Galon, J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Effector memory T cells, early metastasis, and survival in colorectal cancer JO - N Engl J Med VL - 353 UR - https://doi.org/10.1056/NEJMoa051424 DO - 10.1056/NEJMoa051424 ID - Pages2005 ER - TY - JOUR AU - Reiman, J. M. AU - Kmieciak, M. AU - Manjili, M. H. AU - Knutson, K. L. PY - 2007 DA - 2007// TI - Tumor immunoediting and immunosculpting pathways to cancer progression JO - Semin Cancer Biol VL - 17 UR - https://doi.org/10.1016/j.semcancer.2007.06.009 DO - 10.1016/j.semcancer.2007.06.009 ID - Reiman2007 ER - TY - JOUR AU - Shankaran, V. AU - Ikeda, H. AU - Bruce, A. T. AU - White, J. M. AU - Swanson, P. E. AU - Old, L. J. AU - Schreiber, R. D. PY - 2001 DA - 2001// TI - IFNgamma and lymphocytes prevent primary tumour development and shape tumour immunogenicity JO - Nature VL - 410 UR - https://doi.org/10.1038/35074122 DO - 10.1038/35074122 ID - Shankaran2001 ER - TY - JOUR AU - van den Broek, M. E. AU - Kagi, D. AU - Ossendorp, F. AU - Toes, R. AU - Vamvakas, S. AU - Lutz, W. K. AU - Melief, C. J. AU - Zinkernagel, R. M. AU - Hengartner, H. PY - 1996 DA - 1996// TI - Decreased tumor surveillance in perforin-deficient mice JO - J Exp Med VL - 184 UR - https://doi.org/10.1084/jem.184.5.1781 DO - 10.1084/jem.184.5.1781 ID - van den Broek1996 ER - TY - JOUR AU - Carlomagno, C. AU - Perrone, F. AU - Lauria, R. AU - de Laurentiis, M. AU - Gallo, C. AU - Morabito, A. AU - Pettinato, G. AU - Panico, L. AU - Bellelli, T. AU - Apicella, A. PY - 1995 DA - 1995// TI - Prognostic significance of necrosis, elastosis, fibrosis and inflammatory cell reaction in operable breast cancer JO - Oncology VL - 52 UR - https://doi.org/10.1159/000227472 DO - 10.1159/000227472 ID - Carlomagno1995 ER - TY - JOUR AU - Holmberg, L. AU - Adami, H. O. AU - Lindgren, A. AU - Ekbom, A. AU - Sandstrom, A. AU - Bergstrom, R. PY - 1988 DA - 1988// TI - Prognostic significance of the Ackerman classification and other histopathological characteristics in breast cancer. An analysis of 1,349 consecutive cases with complete follow-up over seven years JO - APMIS VL - 96 UR - https://doi.org/10.1111/j.1699-0463.1988.tb00971.x DO - 10.1111/j.1699-0463.1988.tb00971.x ID - Holmberg1988 ER - TY - JOUR AU - Lee, A. H. AU - Gillett, C. E. AU - Ryder, K. AU - Fentiman, I. S. AU - Miles, D. W. AU - Millis, R. R. PY - 2006 DA - 2006// TI - Different patterns of inflammation and prognosis in invasive carcinoma of the breast JO - Histopathology VL - 48 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-2559.2006.02410.x DO - 10.1111/j.1365-2559.2006.02410.x ID - Lee2006 ER - TY - JOUR AU - Pupa, S. M. AU - Bufalino, R. AU - Invernizzi, A. M. AU - Andreola, S. AU - Rilke, F. AU - Lombardi, L. AU - Colnaghi, M. I. AU - Menard, S. PY - 1996 DA - 1996// TI - Macrophage infiltrate and prognosis in c-erbB-2-overexpressing breast carcinomas JO - J Clin Oncol VL - 14 ID - Pupa1996 ER - TY - JOUR AU - Elston, C. W. AU - Gresham, G. A. AU - Rao, G. S. AU - Zebro, T. AU - Haybittle, J. L. AU - Houghton, J. AU - Kearney, G. PY - 1982 DA - 1982// TI - The cancer research campaign (King's/Cambridge) trial for early breast cancer: clinico-pathological aspects JO - Br J Cancer VL - 45 UR - https://doi.org/10.1038/bjc.1982.106 DO - 10.1038/bjc.1982.106 ID - Elston1982 ER - TY - JOUR AU - Menard, S. AU - Casalini, P. AU - Tomasic, G. AU - Pilotti, S. AU - Cascinelli, N. AU - Bufalino, R. AU - Perrone, F. AU - Longhi, C. AU - Rilke, F. AU - Colnaghi, M. I. PY - 1999 DA - 1999// TI - Pathobiologic identification of two distinct breast carcinoma subsets with diverging clinical behaviors JO - Breast Cancer Res Treat VL - 55 UR - https://doi.org/10.1023/A:1006262324959 DO - 10.1023/A:1006262324959 ID - Menard1999 ER - TY - JOUR AU - Desmedt, C. AU - Haibe-Kains, B. AU - Wirapati, P. AU - Buyse, M. AU - Larsimont, D. AU - Bontempi, G. AU - Delorenzi, M. AU - Piccart, M. AU - Sotiriou, C. PY - 2008 DA - 2008// TI - Biological processes associated with breast cancer clinical outcome depend on the molecular subtypes JO - Clin Cancer Res VL - 14 UR - https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-07-4756 DO - 10.1158/1078-0432.CCR-07-4756 ID - Desmedt2008 ER - TY - JOUR AU - Teschendorff, A. E. AU - Caldas, C. PY - 2008 DA - 2008// TI - A robust classifier of high predictive value to identify good prognosis patients in ER-negative breast cancer JO - Breast Cancer Res VL - 10 UR - https://doi.org/10.1186/bcr2138 DO - 10.1186/bcr2138 ID - Teschendorff2008 ER - TY - JOUR AU - Kreike, B. AU - van Kouwenhove, M. AU - Horlings, H. AU - Weigelt, B. AU - Peterse, H. AU - Bartelink, H. AU - van de Vijver, M. J. PY - 2007 DA - 2007// TI - Gene expression profiling and histopathological characterization of triple-negative/basal-like breast carcinomas JO - Breast Cancer Res VL - 9 UR - https://doi.org/10.1186/bcr1771 DO - 10.1186/bcr1771 ID - Kreike2007 ER - TY - JOUR AU - Bai, M. AU - Agnantis, N. J. AU - Kamina, S. AU - Demou, A. AU - Zagorianakou, P. AU - Katsaraki, A. AU - Kanavaros, P. PY - 2001 DA - 2001// TI - In vivo cell kinetics in breast carcinogenesis JO - Breast Cancer Res VL - 3 UR - https://doi.org/10.1186/bcr306 DO - 10.1186/bcr306 ID - Bai2001 ER - TY - JOUR AU - Lee, J. S. AU - Kim, H. S. AU - Jung, J. J. AU - Kim, Y. B. AU - Park, C. S. AU - Lee, M. C. PY - 2001 DA - 2001// TI - Correlation between angiogenesis, apoptosis and cell proliferation in invasive ductal carcinoma of the breast and their relation to tumor behavior JO - Anal Quant Cytol Histol VL - 23 ID - Lee2001 ER - TY - JOUR AU - Lipponen, P. PY - 1999 DA - 1999// TI - Apoptosis in breast cancer: relationship with other pathological parameters JO - Endocr Relat Cancer VL - 6 UR - https://doi.org/10.1677/erc.0.0060013 DO - 10.1677/erc.0.0060013 ID - Lipponen1999 ER - TY - JOUR AU - Schulte-Hermann, R. AU - Bursch, W. AU - Grasl-Kraupp, B. AU - Marian, B. AU - Torok, L. AU - Kahl-Rainer, P. AU - Ellinger, A. PY - 1997 DA - 1997// TI - Concepts of cell death and application to carcinogenesis JO - Toxicol Pathol VL - 25 UR - https://doi.org/10.1177/019262339702500117 DO - 10.1177/019262339702500117 ID - Schulte-Hermann1997 ER - TY - JOUR AU - Kono, H. AU - Rock, K. L. PY - 2008 DA - 2008// TI - How dying cells alert the immune system to danger JO - Nat Rev Immunol VL - 8 UR - https://doi.org/10.1038/nri2215 DO - 10.1038/nri2215 ID - Kono2008 ER - TY - JOUR AU - Nowak, A. K. AU - Lake, R. A. AU - Marzo, A. L. AU - Scott, B. AU - Heath, W. R. AU - Collins, E. J. AU - Frelinger, J. A. AU - Robinson, B. W. PY - 2003 DA - 2003// TI - Induction of tumor cell apoptosis in vivo increases tumor antigen cross-presentation, cross-priming rather than cross-tolerizing host tumor-specific CD8 T cells JO - J Immunol VL - 170 UR - https://doi.org/10.4049/jimmunol.170.10.4905 DO - 10.4049/jimmunol.170.10.4905 ID - Nowak2003 ER - TY - JOUR AU - Rock, K. L. AU - Lai, J. J. AU - Kono, H. PY - 2011 DA - 2011// TI - Innate and adaptive immune responses to cell death JO - Immunol Rev VL - 243 UR - https://doi.org/10.1111/j.1600-065X.2011.01040.x DO - 10.1111/j.1600-065X.2011.01040.x ID - Rock2011 ER - TY - JOUR AU - Martinet, L. AU - Garrido, I. AU - Filleron, T. AU - Le Guellec, S. AU - Bellard, E. AU - Fournie, J. J. AU - Rochaix, P. AU - Girard, J. P. PY - 2011 DA - 2011// TI - Human solid tumors contain high endothelial venules: association with T- and B-lymphocyte infiltration and favorable prognosis in breast cancer JO - Cancer Res VL - 71 UR - https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-11-0431 DO - 10.1158/0008-5472.CAN-11-0431 ID - Martinet2011 ER - TY - JOUR AU - Liu, F. AU - Lang, R. AU - Zhao, J. AU - Zhang, X. AU - Pringle, G. A. AU - Fan, Y. AU - Yin, D. AU - Gu, F. AU - Yao, Z. AU - Fu, L. PY - 2011 DA - 2011// TI - CD8(+) cytotoxic T cell and FOXP3(+) regulatory T cell infiltration in relation to breast cancer survival and molecular subtypes JO - Breast Cancer Res Treat VL - 130 UR - https://doi.org/10.1007/s10549-011-1647-3 DO - 10.1007/s10549-011-1647-3 ID - Liu2011 ER - TY - JOUR AU - Mahmoud, S. M. AU - Paish, E. C. AU - Powe, D. G. AU - Macmillan, R. D. AU - Lee, A. H. AU - Ellis, I. O. AU - Green, A. R. PY - 2011 DA - 2011// TI - An evaluation of the clinical significance of FOXP3+ infiltrating cells in human breast cancer JO - Breast Cancer Res Treat VL - 127 UR - https://doi.org/10.1007/s10549-010-0987-8 DO - 10.1007/s10549-010-0987-8 ID - Mahmoud2011 ER - TY - JOUR AU - Nakamura, R. AU - Sakakibara, M. AU - Nagashima, T. AU - Sangai, T. AU - Arai, M. AU - Fujimori, T. AU - Takano, S. AU - Shida, T. AU - Nakatani, Y. AU - Miyazaki, M. PY - 2009 DA - 2009// TI - Accumulation of regulatory T cells in sentinel lymph nodes is a prognostic predictor in patients with node-negative breast cancer JO - Eur J Cancer VL - 45 UR - https://doi.org/10.1016/j.ejca.2009.03.024 DO - 10.1016/j.ejca.2009.03.024 ID - Nakamura2009 ER - TY - JOUR AU - Yan, M. AU - Jene, N. AU - Byrne, D. AU - Millar, E. K. AU - O'Toole, S. A. AU - McNeil, C. M. AU - Bates, G. J. AU - Harris, A. L. AU - Banham, A. H. AU - Sutherland, R. L. AU - Fox, S. B. PY - 2011 DA - 2011// TI - Recruitment of regulatory T cells is correlated with hypoxia-induced CXCR4 expression, and is associated with poor prognosis in basal-like breast cancers JO - Breast Cancer Res VL - 13 UR - https://doi.org/10.1186/bcr2869 DO - 10.1186/bcr2869 ID - Yan2011 ER - TY - JOUR AU - Carr, J. M. AU - Carrasco, M. J. AU - Thaventhiran, J. E. AU - Bambrough, P. J. AU - Kraman, M. AU - Edwards, A. D. AU - Al-Shamkhani, A. AU - Fearon, D. T. PY - 2006 DA - 2006// TI - CD27 mediates interleukin-2-independent clonal expansion of the CD8+ T cell without effector differentiation JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 103 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0609706104 DO - 10.1073/pnas.0609706104 ID - Carr2006 ER - TY - JOUR AU - Hendriks, J. AU - Gravestein, L. A. AU - Tesselaar, K. AU - van Lier, R. A. AU - Schumacher, T. N. AU - Borst, J. PY - 2000 DA - 2000// TI - CD27 is required for generation and long-term maintenance of T cell immunity JO - Nat Immunol VL - 1 UR - https://doi.org/10.1038/80877 DO - 10.1038/80877 ID - Hendriks2000 ER - TY - JOUR AU - Agematsu, K. AU - Hokibara, S. AU - Nagumo, H. AU - Shinozaki, K. AU - Yamada, S. AU - Komiyama, A. PY - 1999 DA - 1999// TI - Plasma cell generation from B-lymphocytes via CD27/CD70 interaction JO - Leuk Lymphoma VL - 35 UR - https://doi.org/10.3109/10428199909145724 DO - 10.3109/10428199909145724 ID - Agematsu1999 ER - TY - JOUR AU - Agematsu, K. AU - Nagumo, H. AU - Yang, F. C. AU - Nakazawa, T. AU - Fukushima, K. AU - Ito, S. AU - Sugita, K. AU - Mori, T. AU - Kobata, T. AU - Morimoto, C. AU - Komiyama, A. PY - 1997 DA - 1997// TI - B cell subpopulations separated by CD27 and crucial collaboration of CD27+ B cells and helper T cells in immunoglobulin production JO - Eur J Immunol VL - 27 UR - https://doi.org/10.1002/eji.1830270835 DO - 10.1002/eji.1830270835 ID - Agematsu1997 ER - TY - JOUR AU - Hayakawa, Y. AU - Smyth, M. J. PY - 2006 DA - 2006// TI - CD27 dissects mature NK cells into two subsets with distinct responsiveness and migratory capacity JO - J Immunol VL - 176 UR - https://doi.org/10.4049/jimmunol.176.3.1517 DO - 10.4049/jimmunol.176.3.1517 ID - Hayakawa2006 ER - TY - JOUR AU - Chan, O. T. AU - Yang, L. X. PY - 2000 DA - 2000// TI - The immunological effects of taxanes JO - Cancer Immunol Immunother VL - 49 UR - https://doi.org/10.1007/s002620000122 DO - 10.1007/s002620000122 ID - Chan2000 ER - TY - JOUR AU - Haynes, N. M. AU - van der Most, R. G. AU - Lake, R. A. AU - Smyth, M. J. PY - 2008 DA - 2008// TI - Immunogenic anti-cancer chemotherapy as an emerging concept JO - Curr Opin Immunol VL - 20 UR - https://doi.org/10.1016/j.coi.2008.05.008 DO - 10.1016/j.coi.2008.05.008 ID - Haynes2008 ER - TY - JOUR AU - Mattarollo, S. R. AU - Loi, S. AU - Duret, H. AU - Ma, Y. AU - Zitvogel, L. AU - Smyth, M. J. PY - 2011 DA - 2011// TI - Pivotal role of innate and adaptive immunity in anthracycline chemotherapy of established tumors JO - Cancer Res VL - 71 UR - https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-11-0753 DO - 10.1158/0008-5472.CAN-11-0753 ID - Mattarollo2011 ER - TY - JOUR AU - Tsavaris, N. AU - Kosmas, C. AU - Vadiaka, M. AU - Kanelopoulos, P. AU - Boulamatsis, D. PY - 2002 DA - 2002// TI - Immune changes in patients with advanced breast cancer undergoing chemotherapy with taxanes JO - Br J Cancer VL - 87 UR - https://doi.org/10.1038/sj.bjc.6600347 DO - 10.1038/sj.bjc.6600347 ID - Tsavaris2002 ER - TY - JOUR AU - Edgar, R. AU - Domrachev, M. AU - Lash, A. E. PY - 2002 DA - 2002// TI - Gene Expression Omnibus: NCBI gene expression and hybridization array data repository JO - Nucleic Acids Res VL - 30 UR - https://doi.org/10.1093/nar/30.1.207 DO - 10.1093/nar/30.1.207 ID - Edgar2002 ER - TY - STD TI - Gene Expression Omnibus. [http://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE45255] UR - http://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE45255 ID - ref80 ER - TY - CHAP PY - 2010 DA - 2010// TI - R: A Language and Environment for Statistical Computing BT - R Foundation for Statistical Computing. Vienna, Austria ID - ref81 ER - TY - STD TI - Bioconductor [http://www.bioconductor.org/packages/2.12/bioc/html/simpleaffy.html] UR - http://www.bioconductor.org/packages/2.12/bioc/html/simpleaffy.html ID - ref82 ER - TY - JOUR AU - Johnson, W. E. AU - Li, C. AU - Rabinovic, A. PY - 2007 DA - 2007// TI - Adjusting batch effects in microarray expression data using empirical Bayes methods JO - Biostatistics VL - 8 UR - https://doi.org/10.1093/biostatistics/kxj037 DO - 10.1093/biostatistics/kxj037 ID - Johnson2007 ER - TY - JOUR AU - Hu, Z. AU - Fan, C. AU - Oh, D. S. AU - Marron, J. S. AU - He, X. AU - Qaqish, B. F. AU - Livasy, C. AU - Carey, L. A. AU - Reynolds, E. AU - Dressler, L. AU - Nobel, A. AU - Parker, J. AU - Ewend, M. G. AU - Sawyer, L. R. AU - Wu, J. AU - Liu, Y. AU - Nanda, R. AU - Tretiakova, M. AU - Ruiz Orrico, A. AU - Dreher, D. AU - Palazzo, J. P. AU - Perreard, L. AU - Nelson, E. AU - Mone, M. AU - Hansen, H. AU - Mullins, M. AU - Quackenbush, J. F. AU - Ellis, M. J. AU - Olopade, O. I. AU - Bernard, P. S. PY - 2006 DA - 2006// TI - The molecular portraits of breast tumors are conserved across microarray platforms JO - BMC Genomics VL - 7 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-7-96 DO - 10.1186/1471-2164-7-96 ID - Hu2006 ER - TY - JOUR AU - Fan, C. AU - Oh, D. S. AU - Wessels, L. AU - Weigelt, B. AU - Nuyten, D. S. AU - Nobel, A. B. AU - van't Veer, L. J. AU - Perou, C. M. PY - 2006 DA - 2006// TI - Concordance among gene-expression-based predictors for breast cancer JO - N Engl J Med VL - 355 UR - https://doi.org/10.1056/NEJMoa052933 DO - 10.1056/NEJMoa052933 ID - Fan2006 ER - TY - STD TI - UNC Microarray database. [https://genome.unc.edu/pubsup/breastGEO] UR - https://genome.unc.edu/pubsup/breastGEO ID - ref86 ER - TY - JOUR AU - Normand, S. T. AU - Landrum, M. B. AU - Guadagnoli, E. AU - Ayanian, J. Z. AU - Ryan, T. J. AU - Cleary, P. D. AU - McNeil, B. J. PY - 2001 DA - 2001// TI - Validating recommendations for coronary angiography following acute myocardial infarction in the elderly: a matched analysis using propensity scores JO - J Clin Epidemiol VL - 54 UR - https://doi.org/10.1016/S0895-4356(00)00321-8 DO - 10.1016/S0895-4356(00)00321-8 ID - Normand2001 ER - TY - BOOK AU - Therneau, T. PY - 2011 DA - 2011// TI - Survival: survival analysis, including penalized likelihood. R package (version 2.36-5) PB - R Foundation for Statistical Computing CY - Vienna, Austria ID - Therneau2011 ER - TY - JOUR AU - Benjamini, Y. AU - Hochberg, Y. PY - 1995 DA - 1995// TI - Controlling the false discovery rate - a practical and powerful approach to multiple testing JO - Journal of the Royal Statistical Society Series B-Methodological VL - 57 ID - Benjamini1995 ER - TY - STD TI - Eisen Lab Software. [http://rana.lbl.gov/EisenSoftware.htm] UR - http://rana.lbl.gov/EisenSoftware.htm ID - ref90 ER - TY - JOUR AU - Eisen, M. B. AU - Spellman, P. T. AU - Brown, P. O. AU - Botstein, D. PY - 1998 DA - 1998// TI - Cluster analysis and display of genome-wide expression patterns JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 95 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.95.25.14863 DO - 10.1073/pnas.95.25.14863 ID - Eisen1998 ER - TY - JOUR AU - Park, M. Y. AU - Hastie, T. AU - Tibshirani, R. PY - 2007 DA - 2007// TI - Averaged gene expressions for regression JO - Biostatistics VL - 8 UR - https://doi.org/10.1093/biostatistics/kxl002 DO - 10.1093/biostatistics/kxl002 ID - Park2007 ER - TY - JOUR AU - Lash, T. L. AU - Cronin-Fenton, D. AU - Ahern, T. P. AU - Rosenberg, C. L. AU - Lunetta, K. L. AU - Silliman, R. A. AU - Garne, J. P. AU - Sorensen, H. T. AU - Hellberg, Y. AU - Christensen, M. AU - Pedersen, L. AU - Hamilton-Dutoit, S. PY - 2011 DA - 2011// TI - CYP2D6 inhibition and breast cancer recurrence in a population-based study in Denmark JO - J Natl Cancer Inst VL - 103 UR - https://doi.org/10.1093/jnci/djr010 DO - 10.1093/jnci/djr010 ID - Lash2011 ER - TY - JOUR AU - Cronin-Fenton, D. P. AU - Hellberg, Y. AU - Lauridsen, K. L. AU - Ahern, T. P. AU - Garne, J. P. AU - Rosenberg, C. AU - Silliman, R. A. AU - Sorensen, H. T. AU - Lash, T. L. AU - Hamilton-Dutoit, S. PY - 2012 DA - 2012// TI - Factors associated with concordant estrogen receptor expression at diagnosis and centralized re-assay in a Danish population-based breast cancer study JO - Acta Oncol VL - 51 UR - https://doi.org/10.3109/0284186X.2011.633556 DO - 10.3109/0284186X.2011.633556 ID - Cronin-Fenton2012 ER - TY - JOUR AU - Huang da, W. AU - Sherman, B. T. AU - Lempicki, R. A. PY - 2009 DA - 2009// TI - Systematic and integrative analysis of large gene lists using DAVID bioinformatics resources JO - Nat Protoc VL - 4 UR - https://doi.org/10.1038/nprot.2008.211 DO - 10.1038/nprot.2008.211 ID - Huang da2009 ER - TY - STD TI - DAVID. [http://david.abcc.ncifcrf.gov/] UR - http://david.abcc.ncifcrf.gov/ ID - ref96 ER - TY - JOUR AU - Desmedt, C. AU - Piette, F. AU - Loi, S. AU - Wang, Y. AU - Lallemand, F. AU - Haibe-Kains, B. AU - Viale, G. AU - Delorenzi, M. AU - Zhang, Y. AU - d'Assignies, M. S. AU - Bergh, J. AU - Lidereau, R. AU - Ellis, P. AU - Harris, A. L. AU - Klijn, J. G. AU - Foekens, J. A. AU - Cardoso, F. AU - Piccart, M. J. AU - Buyse, M. AU - Sotiriou, C. PY - 2007 DA - 2007// TI - Strong time dependence of the 76-gene prognostic signature for node-negative breast cancer patients in the TRANSBIG multicenter independent validation series JO - Clin Cancer Res VL - 13 UR - https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-06-2765 DO - 10.1158/1078-0432.CCR-06-2765 ID - Desmedt2007 ER -