TY - JOUR AU - Ge, B. AU - Pokholok, D. K. AU - Kwan, T. AU - Grundberg, E. AU - Morcos, L. AU - Verlaan, D. J. AU - Le, J. AU - Koka, V. AU - Lam, K. C. AU - Gagné, V. AU - Dias, J. AU - Hoberman, R. AU - Montpetit, A. AU - Joly, M. M. AU - Harvey, E. J. AU - Sinnett, D. AU - Beaulieu, P. AU - Hamon, R. AU - Graziani, A. AU - Dewar, K. AU - Harmsen, E. AU - Majewski, J. AU - Göring, H. H. AU - Naumova, A. K. AU - Blanchette, M. AU - Gunderson, K. L. AU - Pastinen, T. PY - 2009 DA - 2009// TI - Global patterns of cis variation in human cells revealed by high-density allelic expression analysis JO - Nat Genet VL - 41 UR - https://doi.org/10.1038/ng.473 DO - 10.1038/ng.473 ID - Ge2009 ER - TY - JOUR AU - Morcos, L. AU - Ge, B. AU - Koka, V. AU - Lam, K. C. AU - Pokholok, D. K. AU - Gunderson, K. L. AU - Montpetit, A. AU - Verlaan, D. J. AU - Pastinen, T. PY - 2011 DA - 2011// TI - Genome-wide assessment of imprinted expression in human cells JO - Genome Biol VL - 12 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2011-12-3-r25 DO - 10.1186/gb-2011-12-3-r25 ID - Morcos2011 ER - TY - JOUR AU - Pastinen, T. PY - 2010 DA - 2010// TI - Genome-wide allele-specific analysis: insights into regulatory variation JO - Nat Rev Genet VL - 11 UR - https://doi.org/10.1038/nrg2815 DO - 10.1038/nrg2815 ID - Pastinen2010 ER - TY - JOUR AU - Minks, J. AU - Robinson, W. P. AU - Brown, C. J. PY - 2008 DA - 2008// TI - A skewed view of X chromosome inactivation JO - J Clin Invest VL - 118 UR - https://doi.org/10.1172/JCI34470 DO - 10.1172/JCI34470 ID - Minks2008 ER - TY - JOUR AU - Plagnol, V. AU - Uz, E. AU - Wallace, C. AU - Stevens, H. AU - Clayton, D. AU - Ozcelik, T. AU - Todd, J. A. PY - 2008 DA - 2008// TI - Extreme clonality in lymphoblastoid cell lines with implications for allele specific expression analyses JO - PLoS ONE VL - 3 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0002966 DO - 10.1371/journal.pone.0002966 ID - Plagnol2008 ER - TY - JOUR AU - Wutz, A. PY - 2011 DA - 2011// TI - Gene silencing in X-chromosome inactivation: advances in understanding facultative heterochromatin formation JO - Nat Rev Genet VL - 12 UR - https://doi.org/10.1038/nrg3035 DO - 10.1038/nrg3035 ID - Wutz2011 ER - TY - JOUR AU - Lyon, M. F. PY - 1998 DA - 1998// TI - X-chromosome inactivation: a repeat hypothesis JO - Cytogenet Cell Genet VL - 80 UR - https://doi.org/10.1159/000014969 DO - 10.1159/000014969 ID - Lyon1998 ER - TY - JOUR AU - Pinter, S. F. AU - Sadreyev, R. I. AU - Yildirim, E. AU - Jeon, Y. AU - Ohsumi, T. K. AU - Borowsky, M. AU - Lee, J. T. PY - 2012 DA - 2012// TI - Spreading of X chromosome inactivation via a hierarchy of defined Polycomb stations JO - Genome Res VL - 22 UR - https://doi.org/10.1101/gr.133751.111 DO - 10.1101/gr.133751.111 ID - Pinter2012 ER - TY - JOUR AU - Migeon, B. R. AU - Wolf, S. F. AU - Mareni, C. AU - Axelman, J. PY - 1982 DA - 1982// TI - Derepression with decreased expression of the G6PD locus on the inactive X chromosome in normal human cells JO - Cell VL - 29 UR - https://doi.org/10.1016/0092-8674(82)90175-1 DO - 10.1016/0092-8674(82)90175-1 ID - Migeon1982 ER - TY - JOUR AU - Carrel, L. AU - Willard, H. F. PY - 2005 DA - 2005// TI - X-inactivation profile reveals extensive variability in X-linked gene expression in females JO - Nature VL - 434 UR - https://doi.org/10.1038/nature03479 DO - 10.1038/nature03479 ID - Carrel2005 ER - TY - JOUR AU - Calabrese, J. M. AU - Sun, W. AU - Song, L. AU - Mugford, J. W. AU - Williams, L. AU - Yee, D. AU - Starmer, J. AU - Mieczkowski, P. AU - Crawford, G. E. AU - Magnuson, T. PY - 2012 DA - 2012// TI - Site-specific silencing of regulatory elements as a mechanism of X inactivation JO - Cell VL - 151 UR - https://doi.org/10.1016/j.cell.2012.10.037 DO - 10.1016/j.cell.2012.10.037 ID - Calabrese2012 ER - TY - JOUR AU - Talebizadeh, Z. AU - Simon, S. D. AU - Butler, M. G. PY - 2006 DA - 2006// TI - X chromosome gene expression in human tissues: male and female comparisons JO - Genomics VL - 88 UR - https://doi.org/10.1016/j.ygeno.2006.07.016 DO - 10.1016/j.ygeno.2006.07.016 ID - Talebizadeh2006 ER - TY - JOUR AU - Cotton, A. M. AU - Lam, L. AU - Affleck, J. G. AU - Wilson, I. M. AU - Penaherrera, M. S. AU - McFadden, D. E. AU - Kobor, M. S. AU - Lam, W. L. AU - Robinson, W. P. AU - Brown, C. J. PY - 2011 DA - 2011// TI - Chromosome-wide DNA methylation analysis predicts human tissue-specific X inactivation JO - Hum Genet VL - 130 UR - https://doi.org/10.1007/s00439-011-1007-8 DO - 10.1007/s00439-011-1007-8 ID - Cotton2011 ER - TY - JOUR AU - Sharp, A. J. AU - Stathaki, E. AU - Migliavacca, E. AU - Brahmachary, M. AU - Montgomery, S. B. AU - Dupre, Y. AU - Antonarakis, S. E. PY - 2011 DA - 2011// TI - DNA methylation profiles of human active and inactive X chromosomes JO - Genome Res VL - 21 UR - https://doi.org/10.1101/gr.112680.110 DO - 10.1101/gr.112680.110 ID - Sharp2011 ER - TY - JOUR AU - Carrel, L. AU - Willard, H. F. PY - 1999 DA - 1999// TI - Heterogeneous gene expression from the inactive X chromosome: an X-linked gene that escapes X inactivation in some human cell lines but is inactivated in others JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 96 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.96.13.7364 DO - 10.1073/pnas.96.13.7364 ID - Carrel1999 ER - TY - JOUR AU - Anderson, C. AU - Brown, C. J. PY - 1999 DA - 1999// TI - Polymorphic X-chromosome inactivation of the human TIMP1 gene JO - Am J Hum Genet VL - 65 UR - https://doi.org/10.1086/302556 DO - 10.1086/302556 ID - Anderson1999 ER - TY - JOUR AU - Kucera, K. S. AU - Reddy, T. E. AU - Pauli, F. AU - Gertz, J. AU - Logan, J. E. AU - Myers, R. M. AU - Willard, H. F. PY - 2011 DA - 2011// TI - Allele-specific distribution of RNA polymerase II on female X chromosomes JO - Hum Mol Genet VL - 20 UR - https://doi.org/10.1093/hmg/ddr315 DO - 10.1093/hmg/ddr315 ID - Kucera2011 ER - TY - JOUR AU - Li, N. AU - Carrel, L. PY - 2008 DA - 2008// TI - Escape from X chromosome inactivation is an intrinsic property of the Jarid1c locus JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 105 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0807765105 DO - 10.1073/pnas.0807765105 ID - Li2008 ER - TY - JOUR AU - Filippova, G. N. AU - Cheng, M. K. AU - Moore, J. M. AU - Truong, J. P. AU - Hu, Y. J. AU - Nguyen, D. K. AU - Tsuchiya, K. D. AU - Disteche, C. M. PY - 2005 DA - 2005// TI - Boundaries between chromosomal domains of X inactivation and escape bind CTCF and lack CpG methylation during early development JO - Dev Cell VL - 8 UR - https://doi.org/10.1016/j.devcel.2004.10.018 DO - 10.1016/j.devcel.2004.10.018 ID - Filippova2005 ER - TY - JOUR AU - Gimelbrant, A. AU - Hutchinson, J. N. AU - Thompson, B. R. AU - Chess, A. PY - 2007 DA - 2007// TI - Widespread monoallelic expression on human autosomes JO - Science VL - 318 UR - https://doi.org/10.1126/science.1148910 DO - 10.1126/science.1148910 ID - Gimelbrant2007 ER - TY - JOUR AU - Li, J. Z. AU - Absher, D. M. AU - Tang, H. AU - Southwick, A. M. AU - Casto, A. M. AU - Ramachandran, S. AU - Cann, H. M. AU - Barsh, G. S. AU - Feldman, M. AU - Cavalli-Sforza, L. L. AU - Myers, R. M. PY - 2008 DA - 2008// TI - Worldwide human relationships inferred from genome-wide patterns of variation JO - Science VL - 319 UR - https://doi.org/10.1126/science.1153717 DO - 10.1126/science.1153717 ID - Li2008 ER - TY - JOUR AU - Allen, R. C. AU - Zoghbi, H. Y. AU - Moseley, A. B. AU - Rosenblatt, H. M. AU - Belmont, J. W. PY - 1992 DA - 1992// TI - Methylation of HpaII and HhaI sites near the polymorphic CAG repeat in the human androgen-receptor gene correlates with X chromosome inactivation JO - Am J Hum Genet VL - 51 ID - Allen1992 ER - TY - JOUR AU - Mossner, M. AU - Nolte, F. AU - Hütter, G. AU - Reins, J. AU - Klaumünzer, M. AU - Nowak, V. AU - Obländer, J. AU - Ackermann, K. AU - Will, S. AU - Röhl, H. AU - Neumann, U. AU - Neumann, M. AU - Hopfer, O. AU - Baldus, C. D. AU - Hofmann, W. K. AU - Nowak, D. PY - 2013 DA - 2013// TI - Skewed X-inactivation patterns in ageing healthy and myelodysplastic haematopoiesis determined by a pyrosequencing based transcriptional clonality assay JO - J Med Genet VL - 50 UR - https://doi.org/10.1136/jmedgenet-2012-101093 DO - 10.1136/jmedgenet-2012-101093 ID - Mossner2013 ER - TY - JOUR AU - Swierczek, S. I. AU - Piterkova, L. AU - Jelinek, J. AU - Agarwal, N. AU - Hammoud, S. AU - Wilson, A. AU - Hickman, K. AU - Parker, C. J. AU - Cairns, B. R. AU - Prchal, J. T. PY - 2012 DA - 2012// TI - Methylation of AR locus does not always reflect X chromosome inactivation state JO - Blood VL - 119 UR - https://doi.org/10.1182/blood-2011-11-390351 DO - 10.1182/blood-2011-11-390351 ID - Swierczek2012 ER - TY - JOUR AU - Johnston, C. M. AU - Lovell, F. L. AU - Leongamornlert, D. A. AU - Stranger, B. E. AU - Dermitzakis, E. T. AU - Ross, M. T. PY - 2008 DA - 2008// TI - Large-scale population study of human cell lines indicates that dosage compensation is virtually complete JO - PLoS Genet VL - 4 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pgen.0040009 DO - 10.1371/journal.pgen.0040009 ID - Johnston2008 ER - TY - JOUR AU - Altschul, S. F. AU - Gish, W. AU - Miller, W. AU - Myers, E. W. AU - Lipman, D. J. PY - 1990 DA - 1990// TI - Basic local alignment search tool JO - J Mol Biol VL - 215 UR - https://doi.org/10.1016/S0022-2836(05)80360-2 DO - 10.1016/S0022-2836(05)80360-2 ID - Altschul1990 ER - TY - JOUR AU - D’Esposito, M. AU - Ciccodicola, A. AU - Gianfrancesco, F. AU - Esposito, T. AU - Flagiello, L. AU - Mazzarella, R. AU - Schlessinger, D. AU - D’Urso, M. PY - 1996 DA - 1996// TI - A synaptobrevin-like gene in the Xq28 pseudoautosomal region undergoes X inactivation JO - Nat Genet VL - 13 UR - https://doi.org/10.1038/ng0696-227 DO - 10.1038/ng0696-227 ID - D’Esposito1996 ER - TY - JOUR AU - Miller, A. P. M. AU - Gustashaw, K. AU - Wolff, D. J. AU - Rider, S. H. AU - Monaco, A. P. AU - Eble, B. AU - Schlessinger, D. AU - Gorski, J. L. AU - van Ommen, G. -. J. AU - Weissenbach, J. AU - Willard, H. F. PY - 1995 DA - 1995// TI - Three genes that escape X chromosome inactivation are clustered within a 6 Mb YAC contig and STS map in Xp11.21–p11.22 JO - Hum Mol Genet VL - 4 UR - https://doi.org/10.1093/hmg/4.4.731 DO - 10.1093/hmg/4.4.731 ID - Miller1995 ER - TY - JOUR AU - Sugawara, H. AU - Iwamoto, K. AU - Bundo, M. AU - Ueda, J. AU - Ishigooka, J. AU - Kato, T. PY - 2011 DA - 2011// TI - Comprehensive DNA methylation analysis of human peripheral blood leukocytes and lymphoblastoid cell lines JO - Epigenetics VL - 6 UR - https://doi.org/10.4161/epi.6.4.14876 DO - 10.4161/epi.6.4.14876 ID - Sugawara2011 ER - TY - JOUR AU - Ellis, N. AU - Keitges, E. AU - Gartler, S. M. AU - Rocchi, M. PY - 1987 DA - 1987// TI - High-frequency reactivation of X-linked genes in Chinese hamster X human hybrid cells JO - Somat Cell Mol Genet VL - 13 UR - https://doi.org/10.1007/BF01535202 DO - 10.1007/BF01535202 ID - Ellis1987 ER - TY - JOUR AU - Davis, A. R. AU - Kohane, I. S. PY - 2009 DA - 2009// TI - Expression differences by continent of origin point to the immortalization process JO - Hum Mol Genet VL - 18 UR - https://doi.org/10.1093/hmg/ddp330 DO - 10.1093/hmg/ddp330 ID - Davis2009 ER - TY - JOUR AU - Donnelly, S. L. AU - Wolpert, C. M. AU - Menold, M. M. AU - Bass, M. P. AU - Gilbert, J. R. AU - Cuccaro, M. L. AU - Delong, G. R. AU - Pericak-Vance, M. A. PY - 2000 DA - 2000// TI - Female with autistic disorder and monosomy X (Turner syndrome): parent-of-origin effect of the X chromosome JO - Am J Med Genet VL - 96 UR - https://doi.org/3.0.CO;2-8 DO - 3.0.CO;2-8 ID - Donnelly2000 ER - TY - JOUR AU - Sagi, L. AU - Zuckerman-Levin, N. AU - Gawlik, A. AU - Ghizzoni, L. AU - Buyukgebiz, A. AU - Rakover, Y. AU - Bistritzer, T. AU - Admoni, O. AU - Vottero, A. AU - Baruch, O. AU - Fares, F. AU - Malecka-Tendera, E. AU - Hochberg, Z. PY - 2007 DA - 2007// TI - Clinical significance of the parental origin of the X chromosome in turner syndrome JO - J Clin Endocrinol Metab VL - 92 UR - https://doi.org/10.1210/jc.2006-0158 DO - 10.1210/jc.2006-0158 ID - Sagi2007 ER - TY - CHAP AU - Niida, Y. AU - Yachie, A. PY - 2011 DA - 2011// TI - MAP7D2 is a brain expressing X-linked maternal imprinted gene in humans BT - Nat Precedings ID - Niida2011 ER - TY - JOUR AU - Jackman, S. M. AU - Kong, X. AU - Fant, M. E. PY - 2012 DA - 2012// TI - Plac1 (placenta-specific 1) is essential for normal placental and embryonic development JO - Mol Reprod Dev VL - 79 UR - https://doi.org/10.1002/mrd.22062 DO - 10.1002/mrd.22062 ID - Jackman2012 ER - TY - JOUR AU - Kobayashi, S. AU - Totoki, Y. AU - Soma, M. AU - Matsumoto, K. AU - Fujihara, Y. AU - Toyoda, A. AU - Sakaki, Y. AU - Okabe, M. AU - Ishino, F. PY - 2013 DA - 2013// TI - Identification of an imprinted gene cluster in the X-inactivation center JO - PLoS ONE VL - 8 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0071222 DO - 10.1371/journal.pone.0071222 ID - Kobayashi2013 ER - TY - JOUR AU - Grundberg, E. AU - Adoue, V. AU - Kwan, T. AU - Ge, B. AU - Duan, Q. L. AU - Lam, K. C. AU - Koka, V. AU - Kindmark, A. AU - Weiss, S. T. AU - Tantisira, K. AU - Mallmin, H. AU - Raby, B. A. AU - Nilsson, O. AU - Pastinen, T. PY - 2011 DA - 2011// TI - Global analysis of the impact of environmental perturbation on cis-regulation of gene expression JO - PLoS Genet VL - 7 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1001279 DO - 10.1371/journal.pgen.1001279 ID - Grundberg2011 ER - TY - JOUR AU - Edgar, R. AU - Domrachev, M. AU - Lash, A. E. PY - 2002 DA - 2002// TI - Gene expression omnibus: NCBI gene expression and hybridization array data repository JO - Nucleic Acid Res VL - 30 UR - https://doi.org/10.1093/nar/30.1.207 DO - 10.1093/nar/30.1.207 ID - Edgar2002 ER -