TY - JOUR AU - Goodman, M. AU - Porter, C. A. AU - Czelusniak, J. AU - Page, S. L. AU - Schneider, H. AU - Shoshani, J. AU - Gunnell, G. AU - Groves, C. P. PY - 1998 DA - 1998// TI - Toward a phylogenetic classification of primates based on DNA evidence complemented by fossil evidence JO - Mol Phylogenet Evol VL - 9 UR - https://doi.org/10.1006/mpev.1998.0495 DO - 10.1006/mpev.1998.0495 ID - Goodman1998 ER - TY - JOUR AU - Gibbs, R. A. AU - Rogers, J. AU - Katze, M. G. AU - Bumgarner, R. AU - Weinstock, G. M. AU - Mardis, E. R. AU - Remington, K. A. AU - Strausberg, R. L. AU - Venter, J. C. AU - Wilson, R. K. AU - Batzer, M. A. AU - Bustamante, C. D. AU - Eichler, E. E. AU - Hahn, M. W. AU - Hardison, R. C. AU - Makova, K. D. AU - Miller, W. AU - Milosavljevic, A. AU - Palermo, R. E. AU - Siepel, A. AU - Sikela, J. M. AU - Attaway, T. AU - Bell, S. AU - Bernard, K. E. AU - Buhay, C. J. AU - Chandrabose, M. N. AU - Dao, M. AU - Davis, C. AU - Delehaunty, K. D. AU - Ding, Y. PY - 2007 DA - 2007// TI - Evolutionary and biomedical insights from the rhesus macaque genome JO - Science VL - 316 UR - https://doi.org/10.1126/science.1139247 DO - 10.1126/science.1139247 ID - Gibbs2007 ER - TY - JOUR AU - Colman, R. J. AU - Anderson, R. M. AU - Johnson, S. C. AU - Kastman, E. K. AU - Kosmatka, K. J. AU - Beasley, T. M. AU - Allison, D. B. AU - Cruzen, C. AU - Simmons, H. A. AU - Kemnitz, J. W. AU - Weindruch, R. PY - 2009 DA - 2009// TI - Caloric restriction delays disease onset and mortality in rhesus monkeys JO - Science VL - 325 UR - https://doi.org/10.1126/science.1173635 DO - 10.1126/science.1173635 ID - Colman2009 ER - TY - JOUR AU - Weiss, R. A. PY - 2001 DA - 2001// TI - Polio vaccines exonerated JO - Nature VL - 410 UR - https://doi.org/10.1038/35074222 DO - 10.1038/35074222 ID - Weiss2001 ER - TY - JOUR AU - Yang, S. H. AU - Cheng, P. H. AU - Banta, H. AU - Piotrowska-Nitsche, K. AU - Yang, J. J. AU - Cheng, E. C. AU - Snyder, B. AU - Larkin, K. AU - Liu, J. AU - Orkin, J. AU - Fang, Z. H. AU - Smith, Y. AU - Bachevalier, J. AU - Zola, S. M. AU - Li, S. H. AU - Li, X. J. AU - Chan, A. W. PY - 2008 DA - 2008// TI - Towards a transgenic model of Huntington's disease in a non-human primate JO - Nature VL - 453 UR - https://doi.org/10.1038/nature06975 DO - 10.1038/nature06975 ID - Yang2008 ER - TY - JOUR AU - Chan, A. W. AU - Yang, S. H. PY - 2009 DA - 2009// TI - Generation of transgenic monkeys with human inherited genetic disease JO - Methods VL - 49 UR - https://doi.org/10.1016/j.ymeth.2009.05.007 DO - 10.1016/j.ymeth.2009.05.007 ID - Chan2009 ER - TY - JOUR AU - Disotell, T. R. AU - Tosi, A. J. PY - 2007 DA - 2007// TI - The monkey's perspective JO - Genome Biol VL - 8 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2007-8-9-226 DO - 10.1186/gb-2007-8-9-226 ID - Disotell2007 ER - TY - JOUR AU - Hernandez, R. D. AU - Hubisz, M. J. AU - Wheeler, D. A. AU - Smith, D. G. AU - Ferguson, B. AU - Rogers, J. AU - Nazareth, L. AU - Indap, A. AU - Bourquin, T. AU - McPherson, J. AU - Muzny, D. AU - Gibbs, R. AU - Nielsen, R. AU - Bustamante, C. D. PY - 2007 DA - 2007// TI - Demographic histories and patterns of linkage disequilibrium in Chinese and Indian rhesus macaques JO - Science VL - 316 UR - https://doi.org/10.1126/science.1140462 DO - 10.1126/science.1140462 ID - Hernandez2007 ER - TY - JOUR AU - Trichel, A. M. AU - Rajakumar, P. A. AU - Murphey-Corb, M. PY - 2002 DA - 2002// TI - Species-specific variation in SIV disease progression between Chinese and Indian subspecies of rhesus macaque JO - J Med Primatol VL - 31 UR - https://doi.org/10.1034/j.1600-0684.2002.02003.x DO - 10.1034/j.1600-0684.2002.02003.x ID - Trichel2002 ER - TY - JOUR AU - Ling, B. AU - Veazey, R. S. AU - Luckay, A. AU - Penedo, C. AU - Xu, K. AU - Lifson, J. D. AU - Marx, P. A. PY - 2002 DA - 2002// TI - SIV(mac) pathogenesis in rhesus macaques of Chinese and Indian origin compared with primary HIV infections in humans JO - Aids VL - 16 UR - https://doi.org/10.1097/00002030-200207260-00005 DO - 10.1097/00002030-200207260-00005 ID - Ling2002 ER - TY - JOUR AU - Satkoski, J. AU - Malhi, R. S. AU - Kanthaswamy, S. AU - Tito, R. Y. AU - Malladi, V. S. AU - Smith, D. G. PY - 2008 DA - 2008// TI - Pyrosequencing as a method for SNP identification in the rhesus macaque (Macaca mulatta) JO - BMC Genomics VL - 9 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-9-256 DO - 10.1186/1471-2164-9-256 ID - Satkoski2008 ER - TY - JOUR AU - Rogers, J. AU - Garcia, R. AU - Shelledy, W. AU - Kaplan, J. AU - Arya, A. AU - Johnson, Z. AU - Bergstrom, M. AU - Novakowski, L. AU - Nair, P. AU - Vinson, A. AU - Newman, D. AU - Heckman, G. AU - Cameron, J. PY - 2006 DA - 2006// TI - An initial genetic linkage map of the rhesus macaque (Macaca mulatta) genome using human microsatellite loci JO - Genomics VL - 87 UR - https://doi.org/10.1016/j.ygeno.2005.10.004 DO - 10.1016/j.ygeno.2005.10.004 ID - Rogers2006 ER - TY - JOUR AU - Malhi, R. S. AU - Sickler, B. AU - Lin, D. AU - Satkoski, J. AU - Tito, R. Y. AU - George, D. AU - Kanthaswamy, S. AU - Smith, D. G. PY - 2007 DA - 2007// TI - MamuSNP: a resource for rhesus macaque (Macaca mulatta) genomics JO - PLOs ONE VL - 2 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0000438 DO - 10.1371/journal.pone.0000438 ID - Malhi2007 ER - TY - JOUR AU - Raveendran, M. AU - Harris, R. A. AU - Milosavljevic, A. AU - Johnson, Z. AU - Shelledy, W. AU - Cameron, J. AU - Rogers, J. PY - 2006 DA - 2006// TI - Designing new microsatellite markers for linkage and population genetic analyses in rhesus macaques and other nonhuman primates JO - Genomics VL - 88 UR - https://doi.org/10.1016/j.ygeno.2006.08.009 DO - 10.1016/j.ygeno.2006.08.009 ID - Raveendran2006 ER - TY - JOUR AU - Ferguson, B. AU - Street, S. I. AU - Wright, H. AU - Pearson, C. AU - Jia, Y. AU - Thompson, S. L. AU - Allibone, P. AU - Dubay, C. J. AU - Spindel, E. AU - Norgren, R. B. PY - 2007 DA - 2007// TI - Single nucleotide polymorphism (SNPs) distinguish Indian-origin and Chinese-origin rhesus macaques (Macaca mulatta) JO - BMC Genomics VL - 8 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-8-43 DO - 10.1186/1471-2164-8-43 ID - Ferguson2007 ER - TY - JOUR AU - Khouangsathiene, S. AU - Pearson, C. AU - Street, S. AU - Ferguson, B. AU - Dubay, C. PY - 2008 DA - 2008// TI - MonkeySNP: a web portal for non-human primate single nucleotide polymorphisms JO - Bioinformatics VL - 24 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btn493 DO - 10.1093/bioinformatics/btn493 ID - Khouangsathiene2008 ER - TY - JOUR AU - Li, R. AU - Li, Y. AU - Kristiansen, K. AU - Wang, J. PY - 2008 DA - 2008// TI - SOAP: short oligonucleotide alignment program JO - Bioinformatics VL - 24 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btn025 DO - 10.1093/bioinformatics/btn025 ID - Li2008 ER - TY - JOUR AU - Wang, J. AU - Wang, W. AU - Li, R. AU - Li, Y. AU - Tian, G. AU - Goodman, L. AU - Fan, W. AU - Zhang, J. AU - Li, J. AU - Zhang, J. AU - Guo, Y. AU - Feng, B. AU - Li, H. AU - Lu, Y. AU - Fang, X. AU - Liang, H. AU - Du, Z. AU - Li, D. AU - Zhao, Y. AU - Hu, Y. AU - Yang, Z. AU - Zheng, H. AU - Hellmann, I. AU - Inouye, M. AU - Pool, J. AU - Yi, X. AU - Zhao, J. AU - Duan, J. AU - Zhou, Y. AU - Qin, J. PY - 2008 DA - 2008// TI - The diploid genome sequence of an Asian individual JO - Nature VL - 456 UR - https://doi.org/10.1038/nature07484 DO - 10.1038/nature07484 ID - Wang2008 ER - TY - JOUR AU - Tong, P. AU - Prendergast, J. G. AU - Lohan, A. J. AU - Farrington, S. M. AU - Cronin, S. AU - Friel, N. AU - Bradley, D. G. AU - Hardiman, O. AU - Evans, A. AU - Wilson, J. F. AU - Loftus, B. PY - 2010 DA - 2010// TI - Sequencing and analysis of an Irish human genome JO - Genome Biol VL - 11 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2010-11-9-r91 DO - 10.1186/gb-2010-11-9-r91 ID - Tong2010 ER - TY - JOUR AU - Wang, J. AU - Wang, W. AU - Li, R. AU - Li, Y. AU - Tian, G. AU - Goodman, L. AU - Fan, W. AU - Zhang, J. AU - Li, J. AU - Guo, Y. AU - Feng, B. AU - Li, H. AU - Lu, Y. AU - Fang, X. AU - Liang, H. AU - Du, Z. AU - Li, D. AU - Zhao, Y. AU - Hu, Y. AU - Yang, Z. AU - Zheng, H. AU - Hellmann, I. AU - Inouye, M. AU - Pool, J. AU - Yi, X. AU - Zhao, J. AU - Duan, J. AU - Zhou, Y. AU - Qin, J. AU - Ma, L. PY - 2008 DA - 2008// TI - The diploid genome sequence of an Asian individual JO - Nature VL - 456 UR - https://doi.org/10.1038/nature07484 DO - 10.1038/nature07484 ID - Wang2008 ER - TY - JOUR AU - Levy, S. AU - Sutton, G. AU - Ng, P. C. AU - Feuk, L. AU - Halpern, A. L. AU - Walenz, B. P. AU - Axelrod, N. AU - Huang, J. AU - Kirkness, E. F. AU - Denisov, G. AU - Lin, Y. AU - MacDonald, J. R. AU - Pang, A. W. AU - Shago, M. AU - Stockwell, T. B. AU - Tsiamouri, A. AU - Bafna, V. AU - Bansal, V. AU - Kravitz, S. A. AU - Busam, D. A. AU - Beeson, K. Y. AU - McIntosh, T. C. AU - Remington, K. A. AU - Abril, J. F. AU - Gill, J. AU - Borman, J. AU - Rogers, Y. H. AU - Frazier, M. E. AU - Scherer, S. W. AU - Strausberg, R. L. PY - 2007 DA - 2007// TI - The diploid genome sequence of an individual human JO - PLoS Biol VL - 5 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pbio.0050254 DO - 10.1371/journal.pbio.0050254 ID - Levy2007 ER - TY - JOUR AU - Metzker, M. L. PY - 2010 DA - 2010// TI - Sequencing technologies - the next generation JO - Nat Rev Genet VL - 11 UR - https://doi.org/10.1038/nrg2626 DO - 10.1038/nrg2626 ID - Metzker2010 ER - TY - JOUR AU - McKernan, K. J. AU - Peckham, H. E. AU - Costa, G. L. AU - McLaughlin, S. F. AU - Fu, Y. AU - Tsung, E. F. AU - Clouser, C. R. AU - Duncan, C. AU - Ichikawa, J. K. AU - Lee, C. C. AU - Zhang, Z. AU - Ranade, S. S. AU - Dimalanta, E. T. AU - Hyland, F. C. AU - Sokolsky, T. D. AU - Zhang, L. AU - Sheridan, A. AU - Fu, H. AU - Hendrickson, C. L. AU - Li, B. AU - Kotler, L. AU - Stuart, J. R. AU - Malek, J. A. AU - Manning, J. M. AU - Antipova, A. A. AU - Perez, D. S. AU - Moore, M. P. AU - Hayashibara, K. C. AU - Lyons, M. R. AU - Beaudoin, R. E. PY - 2009 DA - 2009// TI - Sequence and structural variation in a human genome uncovered by short-read, massively parallel ligation sequencing using two-base encoding JO - Genome Res VL - 19 UR - https://doi.org/10.1101/gr.091868.109 DO - 10.1101/gr.091868.109 ID - McKernan2009 ER - TY - JOUR AU - Chun, S. AU - Fay, J. C. PY - 2009 DA - 2009// TI - Identification of deleterious mutations within three human genomes JO - Genome Res VL - 19 UR - https://doi.org/10.1101/gr.092619.109 DO - 10.1101/gr.092619.109 ID - Chun2009 ER - TY - JOUR AU - Hubbard, T. J. AU - Aken, B. L. AU - Ayling, S. AU - Ballester, B. AU - Beal, K. AU - Bragin, E. AU - Brent, S. AU - Chen, Y. AU - Clapham, P. AU - Clarke, L. AU - Coates, G. AU - Fairley, S. AU - Fitzgerald, S. AU - Fernandez-Banet, J. AU - Gordon, L. AU - Graf, S. AU - Haider, S. AU - Hammond, M. AU - Holland, R. AU - Howe, K. AU - Jenkinson, A. AU - Johnson, N. AU - Kahari, A. AU - Keefe, D. AU - Keenan, S. AU - Kinsella, R. AU - Kokocinski, F. AU - Kulesha, E. AU - Lawson, D. AU - Longden, I. PY - 2009 DA - 2009// TI - Ensembl 2009 JO - Nucleic Acids Res VL - 37 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkn828 DO - 10.1093/nar/gkn828 ID - Hubbard2009 ER - TY - JOUR AU - Wishart, D. S. AU - Knox, C. AU - Guo, A. C. AU - Cheng, D. AU - Shrivastava, S. AU - Tzur, D. AU - Gautam, B. AU - Hassanali, M. PY - 2008 DA - 2008// TI - DrugBank: a knowledgebase for drugs, drug actions and drug targets JO - Nucleic Acids Res VL - 36 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkm958 DO - 10.1093/nar/gkm958 ID - Wishart2008 ER - TY - JOUR AU - Overington, J. P. AU - Al-Lazikani, B. AU - Hopkins, A. L. PY - 2006 DA - 2006// TI - How many drug targets are there? JO - Nat Rev Drug Discov VL - 5 UR - https://doi.org/10.1038/nrd2199 DO - 10.1038/nrd2199 ID - Overington2006 ER - TY - JOUR AU - Jegga, A. G. AU - Gowrisankar, S. AU - Chen, J. AU - Aronow, B. J. PY - 2007 DA - 2007// TI - PolyDoms: a whole genome database for the identification of non-synonymous coding SNPs with the potential to impact disease JO - Nucleic Acids Res VL - 35 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkl826 DO - 10.1093/nar/gkl826 ID - Jegga2007 ER - TY - STD TI - CMSNP. [https://doi.org/monkey.genomics.org.cn/] UR - http://monkey.genomics.org.cn/ ID - ref29 ER - TY - JOUR AU - Stein, L. D. AU - Mungall, C. AU - Shu, S. AU - Caudy, M. AU - Mangone, M. AU - Day, A. AU - Nickerson, E. AU - Stajich, J. E. AU - Harris, T. W. AU - Arva, A. AU - Lewis, S. PY - 2002 DA - 2002// TI - The generic genome browser: a building block for a model organism system database JO - Genome Res VL - 12 UR - https://doi.org/10.1101/gr.403602 DO - 10.1101/gr.403602 ID - Stein2002 ER - TY - JOUR AU - Griffiths-Jones, S. AU - Saini, H. K. AU - van Dongen, S. AU - Enright, A. J. PY - 2008 DA - 2008// TI - miRBase: tools for microRNA genomics JO - Nucleic Acids Res VL - 36 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkm952 DO - 10.1093/nar/gkm952 ID - Griffiths-Jones2008 ER - TY - JOUR AU - Loots, G. AU - Ovcharenko, I. PY - 2007 DA - 2007// TI - ECRbase: database of evolutionary conserved regions, promoters, and transcription factor binding sites in vertebrate genomes JO - Bioinformatics VL - 23 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btl546 DO - 10.1093/bioinformatics/btl546 ID - Loots2007 ER - TY - JOUR AU - Hamosh, A. AU - Scott, A. F. AU - Amberger, J. S. AU - Bocchini, C. A. AU - McKusick, V. A. PY - 2005 DA - 2005// TI - Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM), a knowledgebase of human genes and genetic disorders JO - Nucleic Acids Res VL - 33 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gki033 DO - 10.1093/nar/gki033 ID - Hamosh2005 ER - TY - JOUR AU - Finn, R. D. AU - Tate, J. AU - Mistry, J. AU - Coggill, P. C. AU - Sammut, S. J. AU - Hotz, H. R. AU - Ceric, G. AU - Forslund, K. AU - Eddy, S. R. AU - Sonnhammer, E. L. AU - Bateman, A. PY - 2008 DA - 2008// TI - The Pfam protein families database JO - Nucleic Acids Res VL - 36 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkm960 DO - 10.1093/nar/gkm960 ID - Finn2008 ER - TY - JOUR AU - Edgar, R. C. PY - 2004 DA - 2004// TI - MUSCLE: multiple sequence alignment with high accuracy and high throughput JO - Nucleic Acids Res VL - 32 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkh340 DO - 10.1093/nar/gkh340 ID - Edgar2004 ER - TY - STD TI - Gbrowse. [https://doi.org/gmod.org/wiki/Gbrowse] UR - http://gmod.org/wiki/Gbrowse ID - ref36 ER - TY - STD TI - Sequence Read Archive. [https://doi.org/trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/sra.cgi] UR - http://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/sra.cgi ID - ref37 ER -