Table 6 Characterization of our high ranking Populus candidate G-protein coupled receptors
Locus | QFC | GPCRHMM | TMHMM | HMMTOP | Phobius | Pcut-T | Pcut-H | Query | e-value |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Upper bin | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
   Pop205267 | * | * | 7 (out) | 7 (out) | 7 (out) |  |  | Cand3,4,5 | <e-110 |
   Pop241510 | * | * | 7 (out) | 7 (out) | 7 (out) | 7 (out) | 7 (out) | Cand7 | e-130 |
   Pop254437 | * | * | 7 (out) | 7 (out) | 7 (out) | 7 (out) | 7 (out) |  |  |
   Pop256636 | * | * | 7 (out) | 7 (out) | 7 (out) |  |  | Cand7 | 0.0 |
   Pop561523 | * | * | 7 (out) | 7 (out) | 7 (out) | 7 (out) | 7 (out) | Cand7 | 0.0 |
   Pop569632 | * | * | 7 (out) | 7 (out) | 7 (out) |  |  | Cand1 | e-32 |
   Pop742547 | * | * | 7 (out) | 7 (out) | 7 (out) |  |  | Cand1 | e-110 |
   Pop797267 | * | * | 7 (out) | 8 (in) | 7 (out) | 7 (out) | 7 (out) | Cand7 | e-129 |
   Pop820940 | * | * | 7 (out) | 7 (out) | 7 (out) |  |  | GCR1 | e-142 |
   Pop272274 | * | * | 7 (out) | 8 (in) | 7 (out) |  |  | Cand1 | e-114 |
   Pop554569 | * | * | 7 (out) | 7 (out) | 7 (out) | 6 (in) | 7 (out) | Cand7 | e-130 |
   Pop647588 | * | * | 6 (in) | 7 (out) | 7 (out) |  |  |  |  |
Lower bin | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
   Pop294952 | * | -1.05 | 7 (out) | 7 (out) | 7 (out) |  |  | Cand2,8 | <e-115 |
   Pop240991 | * | -2.37 | 7 (out) | 7 (out) | 7 (out) |  |  | Cand2,8 | <e-117 |
   Pop273474 | * | -2.99 | 7 (out) | 7 (out) | 7 (out) | 7 (out) | 7 (out) |  |  |
   Pop822025 | * | -3.67 | 7 (out) | 7 (out) | 7 (out) |  |  |  |  |
   Pop279432 | * | -4.84 | 7 (in) | 7 (out) | 7 (out) |  |  |  |  |
   Pop796139 | * | -5.58 | 7 (in) | 8 (in) | 7 (in) |  |  |  |  |
   Pop762585 | * | -6.23 | 7 (out) | 7 (out) | 7 (out) |  |  |  |  |
   Pop832788 | * | -8.32 | 7 (out) | 7 (out) | 7 (out) |  |  |  |  |