TY - JOUR AU - Nijman, S. M. AU - Luna-Vargas, M. P. AU - Velds, A. AU - Brummelkamp, T. R. AU - Dirac, A. M. AU - Sixma, T. K. AU - Bernards, R. PY - 2005 DA - 2005// TI - A genomic and functional inventory of deubiquitinating enzymes. JO - Cell VL - 123 UR - https://doi.org/10.1016/j.cell.2005.11.007 DO - 10.1016/j.cell.2005.11.007 ID - Nijman2005 ER - TY - CHAP AU - Scheel, H. PY - 2005 DA - 2005// TI - Comparative analysis of the ubiquitin-proteasome system in Homo sapiens and Saccharomyces cerevisiae. BT - PhD thesis ID - Scheel2005 ER - TY - JOUR AU - Shilatifard, A. PY - 2006 DA - 2006// TI - Chromatin modifications by methylation and ubiquitination: implications in the regulation of gene expression. JO - Annu Rev Biochem VL - 75 UR - https://doi.org/10.1146/annurev.biochem.75.103004.142422 DO - 10.1146/annurev.biochem.75.103004.142422 ID - Shilatifard2006 ER - TY - JOUR AU - Ruthenburg, A. J. AU - Li, H. AU - Patel, D. J. AU - Allis, C. D. PY - 2007 DA - 2007// TI - Multivalent engagement of chromatin modifications by linked binding modules. JO - Nat Rev Mol Cell Biol VL - 8 UR - https://doi.org/10.1038/nrm2298 DO - 10.1038/nrm2298 ID - Ruthenburg2007 ER - TY - JOUR AU - Shukla, A. AU - Stanojevic, N. AU - Duan, Z. AU - Sen, P. AU - Bhaumik, S. R. PY - 2006 DA - 2006// TI - Ubp8p, a histone deubiquitinase whose association with SAGA is mediated by Sgf11p, differentially regulates lysine 4 methylation of histone H3 in vivo. JO - Mol Cell Biol VL - 26 UR - https://doi.org/10.1128/MCB.26.9.3339-3352.2006 DO - 10.1128/MCB.26.9.3339-3352.2006 ID - Shukla2006 ER - TY - JOUR AU - Goldknopf, I. L. AU - Busch, H. PY - 1977 DA - 1977// TI - Isopeptide linkage between nonhistone and histone 2A polypeptides of chromosomal conjugate-protein A24. JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 74 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.74.3.864 DO - 10.1073/pnas.74.3.864 ID - Goldknopf1977 ER - TY - JOUR AU - Mueller, R. D. AU - Yasuda, H. AU - Hatch, C. L. AU - Bonner, W. M. AU - Bradbury, E. M. PY - 1985 DA - 1985// TI - Identification of ubiquitinated histones 2A and 2B in Physarum polycephalum. Disappearance of these proteins at metaphase and reappearance at anaphase. JO - J Biol Chem VL - 260 ID - Mueller1985 ER - TY - JOUR AU - Matsui, S. I. AU - Seon, B. K. AU - Sandberg, A. A. PY - 1979 DA - 1979// TI - Disappearance of a structural chromatin protein A24 in mitosis: implications for molecular basis of chromatin condensation. JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 76 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.76.12.6386 DO - 10.1073/pnas.76.12.6386 ID - Matsui1979 ER - TY - JOUR AU - Wang, H. AU - Wang, L. AU - Erdjument-Bromage, H. AU - Vidal, M. AU - Tempst, P. AU - Jones, R. S. AU - Zhang, Y. PY - 2004 DA - 2004// TI - Role of histone H2A ubiquitination in Polycomb silencing. JO - Nature VL - 431 UR - https://doi.org/10.1038/nature02985 DO - 10.1038/nature02985 ID - Wang2004 ER - TY - JOUR AU - de Napoles, M. AU - Mermoud, J. E. AU - Wakao, R. AU - Tang, Y. A. AU - Endoh, M. AU - Appanah, R. AU - Nesterova, T. B. AU - Silva, J. AU - Otte, A. P. AU - Vidal, M. AU - Koseki, H. AU - Brockdorff, N. PY - 2004 DA - 2004// TI - Polycomb group proteins Ring1A/B link ubiquitylation of histone H2A to heritable gene silencing and X inactivation. JO - Dev Cell VL - 7 UR - https://doi.org/10.1016/j.devcel.2004.10.005 DO - 10.1016/j.devcel.2004.10.005 ID - de Napoles2004 ER - TY - JOUR AU - Bergink, S. AU - Salomons, F. A. AU - Hoogstraten, D. AU - Groothuis, T. A. AU - de Waard, H. AU - Wu, J. AU - Yuan, L. AU - Citterio, E. AU - Houtsmuller, A. B. AU - Neefjes, J. AU - Hoeijmakers, J. H. AU - Vermeulen, W. AU - Dantuma, N. P. PY - 2006 DA - 2006// TI - DNA damage triggers nucleotide excision repair-dependent monoubiquitylation of histone H2A. JO - Genes Dev VL - 20 UR - https://doi.org/10.1101/gad.373706 DO - 10.1101/gad.373706 ID - Bergink2006 ER - TY - JOUR AU - Zhu, P. AU - Zhou, W. AU - Wang, J. AU - Puc, J. AU - Ohgi, K. A. AU - Erdjument-Bromage, H. AU - Tempst, P. AU - Glass, C. K. AU - Rosenfeld, M. G. PY - 2007 DA - 2007// TI - A histone H2A deubiquitinase complex coordinating histone acetylation and H1 dissociation in transcriptional regulation. JO - Mol Cell VL - 27 UR - https://doi.org/10.1016/j.molcel.2007.07.024 DO - 10.1016/j.molcel.2007.07.024 ID - Zhu2007 ER - TY - JOUR AU - Maytal-Kivity, V. AU - Reis, N. AU - Hofmann, K. AU - Glickman, M. H. PY - 2002 DA - 2002// TI - MPN+, a putative catalytic motif found in a subset of MPN domain proteins from eukaryotes and prokaryotes, is critical for Rpn11 function. JO - BMC Biochem VL - 3 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2091-3-28 DO - 10.1186/1471-2091-3-28 ID - Maytal-Kivity2002 ER - TY - JOUR AU - Nicassio, F. AU - Corrado, N. AU - Vissers, J. H. AU - Areces, L. B. AU - Bergink, S. AU - Marteijn, J. A. AU - Geverts, B. AU - Houtsmuller, A. B. AU - Vermeulen, W. AU - Di Fiore, P. P. AU - Citterio, E. PY - 2007 DA - 2007// TI - Human USP3 is a chromatin modifier required for S phase progression and genome stability. JO - Curr Biol VL - 17 UR - https://doi.org/10.1016/j.cub.2007.10.034 DO - 10.1016/j.cub.2007.10.034 ID - Nicassio2007 ER - TY - JOUR AU - Henry, K. W. AU - Wyce, A. AU - Lo, W. S. AU - Duggan, L. J. AU - Emre, N. C. AU - Kao, C. F. AU - Pillus, L. AU - Shilatifard, A. AU - Osley, M. A. AU - Berger, S. L. PY - 2003 DA - 2003// TI - Transcriptional activation via sequential histone H2B ubiquitylation and deubiquitylation, mediated by SAGA-associated Ubp8. JO - Genes Dev VL - 17 UR - https://doi.org/10.1101/gad.1144003 DO - 10.1101/gad.1144003 ID - Henry2003 ER - TY - JOUR AU - Joo, H. Y. AU - Zhai, L. AU - Yang, C. AU - Nie, S. AU - Erdjument-Bromage, H. AU - Tempst, P. AU - Chang, C. AU - Wang, H. PY - 2007 DA - 2007// TI - Regulation of cell cycle progression and gene expression by H2A deubiquitination. JO - Nature VL - 449 UR - https://doi.org/10.1038/nature06256 DO - 10.1038/nature06256 ID - Joo2007 ER - TY - JOUR AU - Mimnaugh, E. G. AU - Kayastha, G. AU - McGovern, N. B. AU - Hwang, S. G. AU - Marcu, M. G. AU - Trepel, J. AU - Cai, S. Y. AU - Marchesi, V. T. AU - Neckers, L. PY - 2001 DA - 2001// TI - Caspase-dependent deubiquitination of monoubiquitinated nucleosomal histone H2A induced by diverse apoptogenic stimuli. JO - Cell Death Differ VL - 8 UR - https://doi.org/10.1038/sj.cdd.4400924 DO - 10.1038/sj.cdd.4400924 ID - Mimnaugh2001 ER - TY - JOUR AU - Cao, R. AU - Tsukada, Y. AU - Zhang, Y. PY - 2005 DA - 2005// TI - Role of Bmi-1 and Ring1A in H2A ubiquitylation and Hox gene silencing. JO - Mol Cell VL - 20 UR - https://doi.org/10.1016/j.molcel.2005.12.002 DO - 10.1016/j.molcel.2005.12.002 ID - Cao2005 ER - TY - JOUR AU - Zhu, B. AU - Zheng, Y. AU - Pham, A. D. AU - Mandal, S. S. AU - Erdjument-Bromage, H. AU - Tempst, P. AU - Reinberg, D. PY - 2005 DA - 2005// TI - Monoubiquitination of human histone H2B: the factors involved and their roles in HOX gene regulation. JO - Mol Cell VL - 20 UR - https://doi.org/10.1016/j.molcel.2005.09.025 DO - 10.1016/j.molcel.2005.09.025 ID - Zhu2005 ER - TY - JOUR AU - Cai, S. Y. AU - Babbitt, R. W. AU - Marchesi, V. T. PY - 1999 DA - 1999// TI - A mutant deubiquitinating enzyme (Ubp-M) associates with mitotic chromosomes and blocks cell division. JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 96 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.96.6.2828 DO - 10.1073/pnas.96.6.2828 ID - Cai1999 ER - TY - JOUR AU - Stegmeier, F. AU - Rape, M. AU - Draviam, V. M. AU - Nalepa, G. AU - Sowa, M. E. AU - Ang, X. L. AU - McDonald, E. R. AU - Li, M. Z. AU - Hannon, G. J. AU - Sorger, P. K. AU - Kirschner, M. W. AU - Harper, J. W. AU - Elledge, S. J. PY - 2007 DA - 2007// TI - Anaphase initiation is regulated by antagonistic ubiquitination and deubiquitination activities. JO - Nature VL - 446 UR - https://doi.org/10.1038/nature05694 DO - 10.1038/nature05694 ID - Stegmeier2007 ER - TY - JOUR AU - Stegmeier, F. AU - Sowa, M. E. AU - Nalepa, G. AU - Gygi, S. P. AU - Harper, J. W. AU - Elledge, S. J. PY - 2007 DA - 2007// TI - The tumor suppressor CYLD regulates entry into mitosis. JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 104 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0703268104 DO - 10.1073/pnas.0703268104 ID - Stegmeier2007 ER - TY - JOUR AU - Aravind, L. AU - Iyer, L. M. PY - 2002 DA - 2002// TI - The SWIRM domain: a conserved module found in chromosomal proteins points to novel chromatin-modifying activities. JO - Genome Biol VL - 3 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2002-3-8-research0039 DO - 10.1186/gb-2002-3-8-research0039 ID - Aravind2002 ER - TY - JOUR AU - Aasland, R. AU - Stewart, A. F. AU - Gibson, T. PY - 1996 DA - 1996// TI - The SANT domain: a putative DNA-binding domain in the SWI-SNF and ADA complexes, the transcriptional co-repressor N-CoR and TFIIIB. JO - Trends Biochem Sci VL - 21 ID - Aasland1996 ER - TY - JOUR AU - Yoneyama, M. AU - Tochio, N. AU - Umehara, T. AU - Koshiba, S. AU - Inoue, M. AU - Yabuki, T. AU - Aoki, M. AU - Seki, E. AU - Matsuda, T. AU - Watanabe, S. AU - Tomo, Y. AU - Nishimura, Y. AU - Harada, T. AU - Terada, T. AU - Shirouzu, M. AU - Hayashizaki, Y. AU - Ohara, O. AU - Tanaka, A. AU - Kigawa, T. AU - Yokoyama, S. PY - 2007 DA - 2007// TI - Structural and functional differences of SWIRM domain subtypes. JO - J Mol Biol VL - 369 UR - https://doi.org/10.1016/j.jmb.2007.03.027 DO - 10.1016/j.jmb.2007.03.027 ID - Yoneyama2007 ER - TY - JOUR AU - Reyes-Turcu, F. E. AU - Horton, J. R. AU - Mullally, J. E. AU - Heroux, A. AU - Cheng, X. AU - Wilkinson, K. D. PY - 2006 DA - 2006// TI - The ubiquitin binding domain ZnF UBP recognizes the C-terminal diglycine motif of unanchored ubiquitin. JO - Cell VL - 124 UR - https://doi.org/10.1016/j.cell.2006.02.038 DO - 10.1016/j.cell.2006.02.038 ID - Reyes-Turcu2006 ER - TY - JOUR AU - Pai, M. T. AU - Tzeng, S. R. AU - Kovacs, J. J. AU - Keaton, M. A. AU - Li, S. S. AU - Yao, T. P. AU - Zhou, P. PY - 2007 DA - 2007// TI - Solution structure of the Ubp-M BUZ domain, a highly specific protein module that recognizes the C-terminal tail of free ubiquitin. JO - J Mol Biol VL - 370 UR - https://doi.org/10.1016/j.jmb.2007.04.015 DO - 10.1016/j.jmb.2007.04.015 ID - Pai2007 ER - TY - JOUR AU - Nakagawa, T. AU - Kajitani, T. AU - Togo, S. AU - Masuko, N. AU - Ohdan, H. AU - Hishikawa, Y. AU - Koji, T. AU - Matsuyama, T. AU - Ikura, T. AU - Muramatsu, M. AU - Ito, T. PY - 2008 DA - 2008// TI - Deubiquitylation of histone H2A activates transcriptional initiation via trans-histone cross-talk with H3K4 di- and trimethylation. JO - Genes Dev VL - 22 UR - https://doi.org/10.1101/gad.1609708 DO - 10.1101/gad.1609708 ID - Nakagawa2008 ER -