TY - JOUR AU - Lapa, S. AU - Mikheev, M. AU - Shchelkunov, S. AU - Mikhailovich, V. AU - Sobolev, A. AU - Blinov, V. AU - Babkin, I. AU - Guskov, A. AU - Sokunova, E. AU - Zasedatelev, A. PY - 2002 DA - 2002// TI - Species-level identification of orthopoxviruses with an oligonucleotide microchip. JO - J Clin Microbiol VL - 40 UR - https://doi.org/10.1128/JCM.40.3.753-757.2002 DO - 10.1128/JCM.40.3.753-757.2002 ID - Lapa2002 ER - TY - JOUR AU - Boonham, N. AU - Walsh, K. AU - Smith, P. AU - Madagan, K. AU - Graham, I. AU - Barker, I. PY - 2003 DA - 2003// TI - Detection of potato viruses using microarray technology: towards a generic method for plant viral disease diagnosis. JO - J Virol Methods VL - 108 UR - https://doi.org/10.1016/S0166-0934(02)00284-7 DO - 10.1016/S0166-0934(02)00284-7 ID - Boonham2003 ER - TY - JOUR AU - Song, Y. AU - Dai, E. AU - Wang, J. AU - Liu, H. AU - Zhai, J. AU - Chen, C. AU - Du, Z. AU - Guo, Z. AU - Yang, R. PY - 2006 DA - 2006// TI - Genotyping of hepatitis B virus HBV by oligonucleotides microarray. JO - Mol Cell Probes VL - 20 UR - https://doi.org/10.1016/j.mcp.2005.11.004 DO - 10.1016/j.mcp.2005.11.004 ID - Song2006 ER - TY - JOUR AU - Wang, D. AU - Urisman, A. AU - Liu, Y. T. AU - Springer, M. AU - Ksiazek, T. G. AU - Erdman, D. D. AU - Mardis, E. R. AU - Hickenbotham, M. AU - Magrini, V. AU - Eldred, J. PY - 2003 DA - 2003// TI - Viral discovery and sequence recovery using DNA microarrays. JO - PLoS Biol VL - 1 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pbio.0000002 DO - 10.1371/journal.pbio.0000002 ID - Wang2003 ER - TY - JOUR AU - Perrin, A. AU - Duracher, D. AU - Perret, M. AU - Cleuziat, P. AU - Mandrand, B. PY - 2003 DA - 2003// TI - A combined oligonucleotide and protein microarray for the codetection of nucleic acids and antibodies associated with human immunodeficiency virus, hepatitis B virus, and hepatitis C virus infections. JO - Anal Biochem VL - 322 UR - https://doi.org/10.1016/j.ab.2003.08.002 DO - 10.1016/j.ab.2003.08.002 ID - Perrin2003 ER - TY - JOUR AU - Sergeev, N. AU - Distler, M. AU - Courtney, S. AU - Al-Khaldi, S. F. AU - Volokhov, D. AU - Chizhikov, V. AU - Rasooly, A. PY - 2004 DA - 2004// TI - Multipathogen oligonucleotide microarray for environmental and biodefense applications. JO - Biosens Bioelectron VL - 20 UR - https://doi.org/10.1016/j.bios.2004.04.030 DO - 10.1016/j.bios.2004.04.030 ID - Sergeev2004 ER - TY - JOUR AU - Burton, J. E. AU - Oshota, O. J. AU - North, E. AU - Hudson, M. J. AU - Polyanskaya, N. AU - Brehm, J. AU - Lloyd, G. AU - Silman, N. J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Development of a multi-pathogen oligonucleotide microarray for detection of Bacillus anthracis. JO - Mol Cell Probes VL - 19 UR - https://doi.org/10.1016/j.mcp.2005.06.004 DO - 10.1016/j.mcp.2005.06.004 ID - Burton2005 ER - TY - JOUR AU - Lemarchand, K. AU - Masson, L. AU - Brousseau, R. PY - 2004 DA - 2004// TI - Molecular biology and DNA microarray technology for microbial quality monitoring of water. JO - Crit Rev Microbiol VL - 30 UR - https://doi.org/10.1080/10408410490435142 DO - 10.1080/10408410490435142 ID - Lemarchand2004 ER - TY - JOUR AU - Urisman, A. AU - Fischer, K. F. AU - Chiu, C. Y. AU - Kistler, A. L. AU - Beck, S. AU - Wang, D. AU - DeRisi, J. L. PY - 2005 DA - 2005// TI - E-Predict: a computational strategy for species identification based on observed DNA microarray hybridization patterns. JO - Genome Biol VL - 69 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2005-6-9-r78 DO - 10.1186/gb-2005-6-9-r78 ID - Urisman2005 ER - TY - STD TI - The R Project for Statistical Computing. [http://www.R-project.org] UR - http://www.R-project.org ID - ref10 ER - TY - JOUR AU - Gentleman, R. C. AU - Carey, V. J. AU - Bates, D. M. AU - Bolstad, B. AU - Dettling, M. AU - Dudoit, S. AU - Ellis, B. AU - Gautier, L. AU - Ge, Y. AU - Gentry, J. PY - 2004 DA - 2004// TI - Bioconductor: open software development for computational biology and bioinformatics. JO - Genome Biol VL - 510 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2004-5-10-r80 DO - 10.1186/gb-2004-5-10-r80 ID - Gentleman2004 ER - TY - CHAP AU - Smyth, G. K. ED - Gentleman, R. ED - Carey, V. ED - Dudoit, S. ED - Irizarry, R. ED - Huber, W. PY - 2005 DA - 2005// TI - Limma: linear models for microarray data. BT - Bioinformatics and Computational Biology Solutions using R and Bioconductor PB - Springer CY - New York ID - Smyth2005 ER - TY - JOUR AU - Gautier, L. AU - Cope, L. AU - Bolstad, B. M. AU - Irizarry, R. A. PY - 2004 DA - 2004// TI - affy - analysis of Affymetrix GeneChip data at the probe level. JO - Bioinformatics VL - 20 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btg405 DO - 10.1093/bioinformatics/btg405 ID - Gautier2004 ER - TY - JOUR AU - Barrett, T. AU - Suzek, T. O. AU - Troup, D. B. AU - Wilhite, S. E. AU - Ngau, W. C. AU - Ledoux, P. AU - Rudnev, D. AU - Lash, A. E. AU - Fujibuchi, W. AU - Edgar, R. PY - 2005 DA - 2005// TI - NCBI GEO: mining millions of expression profiles - database and tools. JO - Nucleic Acids Res VL - 33 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gki022 DO - 10.1093/nar/gki022 ID - Barrett2005 ER - TY - STD TI - Full Results from DetectiV for GSE2228. [http://detectiv.sf.net/table3.html] UR - http://detectiv.sf.net/table3.html ID - ref15 ER - TY - JOUR AU - Wheeler, D. L. AU - Chappey, C. AU - Lash, A. E. AU - Leipe, D. D. AU - Madden, T. L. AU - Schuler, G. D. AU - Tatusova, T. A. AU - Rapp, B. A. PY - 2000 DA - 2000// TI - Database resources of the National Center for Biotechnology Information. JO - Nucleic Acids Res VL - 28 UR - https://doi.org/10.1093/nar/28.1.10 DO - 10.1093/nar/28.1.10 ID - Wheeler2000 ER - TY - STD TI - Full Results from DetectiV for GSE8746. [http://detectiv.sf.net/VA1out.html] UR - http://detectiv.sf.net/VA1out.html ID - ref17 ER - TY - JOUR AU - Wang, D. AU - Coscoy, L. AU - Zylberberg, M. AU - Avila, P. C. AU - Boushey, H. A. AU - Ganem, D. AU - DeRisi, J. L. PY - 2002 DA - 2002// TI - Microarray-based detection and genotyping of viral pathogens. JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 99 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.242579699 DO - 10.1073/pnas.242579699 ID - Wang2002 ER - TY - JOUR AU - Benjamini, Y. AU - Hochberg, Y. PY - 1995 DA - 1995// TI - Controlling the false discovery rate: a practical and powerful approach to multiple testing. JO - J Roy Stat Soc B VL - 57 ID - Benjamini1995 ER - TY - STD TI - The DetectiV Website. [http://detectiv.sf.net/] UR - http://detectiv.sf.net/ ID - ref20 ER -