TY - JOUR AU - Denli, A. M. AU - Tops, B. B. AU - Plasterk, R. H. AU - Ketting, R. F. AU - Hannon, G. J. PY - 2004 DA - 2004// TI - Processing of primary microRNAs by the Microprocessor complex. JO - Nature VL - 432 UR - https://doi.org/10.1038/nature03049 DO - 10.1038/nature03049 ID - Denli2004 ER - TY - JOUR AU - Bartel, D. P. PY - 2004 DA - 2004// TI - MicroRNAs: genomics, biogenesis, mechanism, and function. JO - Cell VL - 116 UR - https://doi.org/10.1016/S0092-8674(04)00045-5 DO - 10.1016/S0092-8674(04)00045-5 ID - Bartel2004 ER - TY - JOUR AU - Ambros, V. PY - 2004 DA - 2004// TI - The functions of animal microRNAs. JO - Nature VL - 431 UR - https://doi.org/10.1038/nature02871 DO - 10.1038/nature02871 ID - Ambros2004 ER - TY - JOUR AU - Meister, G. AU - Tuschl, T. PY - 2004 DA - 2004// TI - Mechanisms of gene silencing by double-stranded RNA. JO - Nature VL - 431 UR - https://doi.org/10.1038/nature02873 DO - 10.1038/nature02873 ID - Meister2004 ER - TY - JOUR AU - Hobert, O. PY - 2004 DA - 2004// TI - Common logic of transcription factor and microRNA action. JO - Trends Biochem Sci VL - 29 UR - https://doi.org/10.1016/j.tibs.2004.07.001 DO - 10.1016/j.tibs.2004.07.001 ID - Hobert2004 ER - TY - JOUR AU - Calin, G. A. AU - Dumitru, C. D. AU - Shimizu, M. AU - Bichi, R. AU - Zupo, S. AU - Noch, E. AU - Aldler, H. AU - Rattan, S. AU - Keating, M. AU - Rai, K. PY - 2002 DA - 2002// TI - Frequent deletions and down-regulation of micro-RNA genes miR15 and miR16 at 13q14 in chronic lymphocytic leukemia. JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 99 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.242606799 DO - 10.1073/pnas.242606799 ID - Calin2002 ER - TY - JOUR AU - Calin, G. A. AU - Liu, C. G. AU - Sevignani, C. AU - Ferracin, M. AU - Felli, N. AU - Dumitru, C. D. AU - Shimizu, M. AU - Cimmino, A. AU - Zupo, S. AU - Dono, M. PY - 2004 DA - 2004// TI - MicroRNA profiling reveals distinct signatures in B cell chronic lymphocytic leukemias. JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 101 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0404432101 DO - 10.1073/pnas.0404432101 ID - Calin2004 ER - TY - JOUR AU - Griffiths-Jones, S. PY - 2004 DA - 2004// TI - The microRNA Registry. JO - Nucleic Acids Res VL - 32 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkh023 DO - 10.1093/nar/gkh023 ID - Griffiths-Jones2004 ER - TY - JOUR AU - Berezikov, E. AU - Guryev, V. AU - van de Belt, J. AU - Wienholds, E. AU - Plasterk, R. H. AU - Cuppen, E. PY - 2005 DA - 2005// TI - Phylogenetic shadowing and computational identification of human microRNA genes. JO - Cell VL - 120 UR - https://doi.org/10.1016/j.cell.2004.12.031 DO - 10.1016/j.cell.2004.12.031 ID - Berezikov2005 ER - TY - JOUR AU - Xie, X. AU - Lu, J. AU - Kulbokas, E. J. AU - Golub, T. R. AU - Mootha, V. AU - Lindblad-Toh, K. AU - Lander, E. S. AU - Kellis, M. PY - 2005 DA - 2005// TI - Systematic discovery of regulatory motifs in human promoters and 3' UTRs by comparison of several mammals. JO - Nature VL - 434 UR - https://doi.org/10.1038/nature03441 DO - 10.1038/nature03441 ID - Xie2005 ER - TY - JOUR AU - Ambros, V. PY - 2003 DA - 2003// TI - MicroRNA pathways in flies and worms: growth, death, fat, stress, and timing. JO - Cell VL - 113 UR - https://doi.org/10.1016/S0092-8674(03)00428-8 DO - 10.1016/S0092-8674(03)00428-8 ID - Ambros2003 ER - TY - JOUR AU - Lim, L. P. AU - Lau, N. C. AU - Garrett-Engele, P. AU - Grimson, A. AU - Schelter, J. M. AU - Castle, J. AU - Bartel, D. P. AU - Linsley, P. S. AU - Johnson, J. M. PY - 2005 DA - 2005// TI - Microarray analysis shows that some microRNAs downregulate large numbers of target mRNAs. JO - Nature VL - 433 UR - https://doi.org/10.1038/nature03315 DO - 10.1038/nature03315 ID - Lim2005 ER - TY - JOUR AU - Miska, E. A. AU - Alvarez-Saavedra, E. AU - Townsend, M. AU - Yoshii, A. AU - Sestan, N. AU - Rakic, P. AU - Constantine-Paton, M. AU - Horvitz, H. R. PY - 2004 DA - 2004// TI - Microarray analysis of microRNA expression in the developing mammalian brain. JO - Genome Biol VL - 5 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2004-5-9-r68 DO - 10.1186/gb-2004-5-9-r68 ID - Miska2004 ER - TY - JOUR AU - Sempere, L. F. AU - Freemantle, S. AU - Pitha-Rowe, I. AU - Moss, E. AU - Dmitrovsky, E. AU - Ambros, V. PY - 2004 DA - 2004// TI - Expression profiling of mammalian microRNAs uncovers a subset of brain-expressed microRNAs with possible roles in murine and human neuronal differentiation. JO - Genome Biol VL - 5 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2004-5-3-r13 DO - 10.1186/gb-2004-5-3-r13 ID - Sempere2004 ER - TY - JOUR AU - Baskerville, S. AU - Bartel, D. P. PY - 2005 DA - 2005// TI - Microarray profiling of microRNAs reveals frequent coexpression with neighboring miRNAs and host genes. JO - RNA VL - 11 UR - https://doi.org/10.1261/rna.7240905 DO - 10.1261/rna.7240905 ID - Baskerville2005 ER - TY - JOUR AU - Galli, S. J. AU - Kalesnikoff, J. AU - Grimbaldeston, M. A. AU - Piliponsky, A. M. AU - Williams, C. M. AU - Tsai, M. PY - 2005 DA - 2005// TI - Mast cells as 'tunable' effector and immunoregulatory cells: recent advances. JO - Annu Rev Immunol VL - 23 UR - https://doi.org/10.1146/annurev.immunol.21.120601.141025 DO - 10.1146/annurev.immunol.21.120601.141025 ID - Galli2005 ER - TY - JOUR AU - Esau, C. AU - Kang, X. AU - Peralta, E. AU - Hanson, E. AU - Marcusson, E. G. AU - Ravichandran, L. V. AU - Sun, Y. AU - Koo, S. AU - Perera, R. J. AU - Jain, R. PY - 2004 DA - 2004// TI - MicroRNA-143 regulates adipocyte differentiation. JO - J Biol Chem VL - 279 UR - https://doi.org/10.1074/jbc.C400438200 DO - 10.1074/jbc.C400438200 ID - Esau2004 ER - TY - JOUR AU - Thomson, J. M. AU - Parker, J. AU - Perou, C. M. AU - Hammond, S. M. PY - 2004 DA - 2004// TI - A custom microarray platform for analysis of microRNA gene expression. JO - Nat Methods VL - 1 UR - https://doi.org/10.1038/nmeth704 DO - 10.1038/nmeth704 ID - Thomson2004 ER - TY - JOUR AU - Nelson, P. T. AU - Baldwin, D. A. AU - Scearce, L. M. AU - Oberholtzer, J. C. AU - Tobias, J. W. AU - Mourelatos, Z. PY - 2004 DA - 2004// TI - Microarray-based, high-throughput gene expression profiling of microRNAs. JO - Nat Methods VL - 1 UR - https://doi.org/10.1038/nmeth717 DO - 10.1038/nmeth717 ID - Nelson2004 ER - TY - JOUR AU - Krichevsky, A. M. AU - King, K. S. AU - Donahue, C. P. AU - Khrapko, K. AU - Kosik, K. S. PY - 2003 DA - 2003// TI - A microRNA array reveals extensive regulation of microRNAs during brain development. JO - RNA VL - 9 UR - https://doi.org/10.1261/rna.5980303 DO - 10.1261/rna.5980303 ID - Krichevsky2003 ER - TY - JOUR AU - DeKoter, R. P. AU - Walsh, J. C. AU - Singh, H. PY - 1998 DA - 1998// TI - PU.1 regulates both cytokine-dependent proliferation and differentiation of granulocyte/macrophage progenitors. JO - EMBO J VL - 17 UR - https://doi.org/10.1093/emboj/17.15.4456 DO - 10.1093/emboj/17.15.4456 ID - DeKoter1998 ER - TY - JOUR AU - Walsh, J. C. AU - DeKoter, R. P. AU - Lee, H. AU - Smith, E. D. AU - Lancki, D. W. AU - Gurish, M. F. AU - Friend, D. S. AU - Stevens, R. L. AU - Anastasi, J. AU - Singh, H. PY - 2002 DA - 2002// TI - Cooperative and antagonistic interplay between PU.1 and GATA-2 in the specification of myeloid cell fates. JO - Immunity VL - 17 UR - https://doi.org/10.1016/S1074-7613(02)00452-1 DO - 10.1016/S1074-7613(02)00452-1 ID - Walsh2002 ER - TY - JOUR AU - Chen, C. Z. AU - Li, L. AU - Lodish, H. F. AU - Bartel, D. P. PY - 2004 DA - 2004// TI - MicroRNAs modulate hematopoietic lineage differentiation. JO - Science VL - 303 UR - https://doi.org/10.1126/science.1091903 DO - 10.1126/science.1091903 ID - Chen2004 ER - TY - JOUR AU - Ansel, K. M. AU - Lee, D. U. AU - Rao, A. PY - 2003 DA - 2003// TI - An epigenetic view of helper T cell differentiation. JO - Nat Immunol VL - 4 UR - https://doi.org/10.1038/ni0703-616 DO - 10.1038/ni0703-616 ID - Ansel2003 ER - TY - JOUR AU - Murphy, K. M. AU - Reiner, S. L. PY - 2002 DA - 2002// TI - The lineage decisions of helper T cells. JO - Nat Rev Immunol VL - 2 UR - https://doi.org/10.1038/nri954 DO - 10.1038/nri954 ID - Murphy2002 ER - TY - JOUR AU - Lewis, B. P. AU - Shih, I. H. AU - Jones-Rhoades, M. W. AU - Bartel, D. P. AU - Burge, C. B. PY - 2003 DA - 2003// TI - Prediction of mammalian microRNA targets. JO - Cell VL - 115 UR - https://doi.org/10.1016/S0092-8674(03)01018-3 DO - 10.1016/S0092-8674(03)01018-3 ID - Lewis2003 ER - TY - JOUR AU - Lewis, B. P. AU - Burge, C. B. AU - Bartel, D. P. PY - 2005 DA - 2005// TI - Conserved seed pairing, often flanked by adenosines, indicates that thousands of human genes are microrna targets. JO - Cell VL - 120 UR - https://doi.org/10.1016/j.cell.2004.12.035 DO - 10.1016/j.cell.2004.12.035 ID - Lewis2005 ER - TY - JOUR AU - Rajewsky, N. AU - Socci, N. D. PY - 2004 DA - 2004// TI - Computational identification of microRNA targets. JO - Dev Biol VL - 267 UR - https://doi.org/10.1016/j.ydbio.2003.12.003 DO - 10.1016/j.ydbio.2003.12.003 ID - Rajewsky2004 ER - TY - JOUR AU - John, B. AU - Enright, A. J. AU - Aravin, A. AU - Tuschl, T. AU - Sander, C. AU - Marks, D. S. PY - 2004 DA - 2004// TI - Human microRNA targets. JO - PLoS Biol VL - 2 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pbio.0020363 DO - 10.1371/journal.pbio.0020363 ID - John2004 ER - TY - JOUR AU - Krek, A. AU - Grun, D. AU - Poy, M. N. AU - Wolf, R. AU - Rosenberg, L. AU - Epstein, E. J. AU - Macmenamin, P. AU - da Piedade, I. AU - Gunsalus, K. C. AU - Stoffel, M. PY - 2005 DA - 2005// TI - Combinatorial microRNA target predictions. JO - Nat Genet VL - 37 UR - https://doi.org/10.1038/ng1536 DO - 10.1038/ng1536 ID - Krek2005 ER - TY - JOUR AU - Akashi, K. AU - Traver, D. AU - Miyamoto, T. AU - Weissman, I. L. PY - 2000 DA - 2000// TI - A clonogenic common myeloid progenitor that gives rise to all myeloid lineages. JO - Nature VL - 404 UR - https://doi.org/10.1038/35004599 DO - 10.1038/35004599 ID - Akashi2000 ER - TY - JOUR AU - DeKoter, R. P. AU - Singh, H. PY - 2000 DA - 2000// TI - Regulation of B lymphocyte and macrophage development by graded expression of PU.1. JO - Science VL - 288 UR - https://doi.org/10.1126/science.288.5470.1439 DO - 10.1126/science.288.5470.1439 ID - DeKoter2000 ER - TY - JOUR AU - Ansel, K. M. AU - Greenwald, R. J. AU - Agarwal, S. AU - Bassing, C. H. AU - Monticelli, S. AU - Interlandi, J. AU - Djuretic, I. M. AU - Lee, D. U. AU - Sharpe, A. H. AU - Alt, F. W. PY - 2004 DA - 2004// TI - Deletion of a conserved Il4 silencer impairs T helper type 1-mediated immunity. JO - Nat Immunol VL - 5 UR - https://doi.org/10.1038/ni1135 DO - 10.1038/ni1135 ID - Ansel2004 ER - TY - JOUR AU - Solymar, D. C. AU - Agarwal, S. AU - Bassing, C. H. AU - Alt, F. W. AU - Rao, A. PY - 2002 DA - 2002// TI - A 3' enhancer in the IL-4 gene regulates cytokine production by Th2 cells and mast cells. JO - Immunity VL - 17 UR - https://doi.org/10.1016/S1074-7613(02)00334-5 DO - 10.1016/S1074-7613(02)00334-5 ID - Solymar2002 ER - TY - JOUR AU - Avni, O. AU - Lee, D. AU - Macian, F. AU - Szabo, S. J. AU - Glimcher, L. H. AU - Rao, A. PY - 2002 DA - 2002// TI - T(H) cell differentiation is accompanied by dynamic changes in histone acetylation of cytokine genes. JO - Nat Immunol VL - 3 ID - Avni2002 ER - TY - JOUR AU - Agarwal, S. AU - Rao, A. PY - 1998 DA - 1998// TI - Modulation of chromatin structure regulates cytokine gene expression during T cell differentiation. JO - Immunity VL - 9 UR - https://doi.org/10.1016/S1074-7613(00)80642-1 DO - 10.1016/S1074-7613(00)80642-1 ID - Agarwal1998 ER - TY - JOUR AU - Huber, W. AU - von Heydebreck, A. AU - Sultmann, H. AU - Poustka, A. AU - Vingron, M. PY - 2002 DA - 2002// TI - Variance stabilization applied to microarray data calibration and to the quantification of differential expression. JO - Bioinformatics VL - 18 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/18.suppl_1.S96 DO - 10.1093/bioinformatics/18.suppl_1.S96 ID - Huber2002 ER - TY - JOUR AU - Baldi, P. AU - Long, A. D. PY - 2001 DA - 2001// TI - A Bayesian framework for the analysis of microarray expression data: regularized t-test and statistical inferences of gene changes. JO - Bioinformatics VL - 17 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/17.6.509 DO - 10.1093/bioinformatics/17.6.509 ID - Baldi2001 ER -