From: Promoter features related to tissue specificity as measured by Shannon entropy
Features | Total fraction | H 0-3 | H 3-4 | H 4-5 | ||
---|---|---|---|---|---|---|
CGI | TATA | YY1 | Â | Most specific | Semi-specific | Least specific |
 |  |  | 3,552 | 271 | 602 | 2679 |
 |  |  | 1.00 | 0.08 | 0.17 | 0.75 |
CGI+ | Â | Â | 2,434 | 56 | 306 | 2072 |
 |  |  | 0.69 | 0.02 | 0.13 | 0.85 |
 |  |  |  | 0.30 | 0.74 | 1.13 |
CGI- | Â | Â | 1,118 | 215 | 296 | 607 |
 |  |  | 0.31 | 0.19 | 0.26 | 0.54 |
 |  |  |  | 2.52 | 1.56 | 0.72 |
 | TATA+ |  | 604 | 136 | 175 | 293 |
 |  |  | 0.17 | 0.23 | 0.29 | 0.49 |
 |  |  |  | 2.95 | 1.71 | 0.64 |
 | TATA- |  | 2,949 | 135 | 427 | 2,387 |
 |  |  | 0.83 | 0.05 | 0.14 | 0.81 |
 |  |  |  | 0.60 | 0.85 | 1.07 |
CGI+ | TATA+ | Â | 284 | 19 | 82 | 183 |
 |  |  | 0.08 | 0.07 | 0.29 | 0.64 |
 |  |  |  | 0.88 | 1.70 | 0.85 |
CGI- | TATA+ | Â | 320 | 117 | 93 | 110 |
 |  |  | 0.09 | 0.37 | 0.29 | 0.34 |
 |  |  |  | 4.79 | 1.71 | 0.46 |
CGI+ | TATA- | Â | 2,150 | 37 | 224 | 1,889 |
 |  |  | 0.61 | 0.02 | 0.10 | 0.88 |
 |  |  |  | 0.23 | 0.61 | 1.16 |
CGI- | TATA- | Â | 798 | 98 | 203 | 497 |
 |  |  | 0.22 | 0.12 | 0.25 | 0.62 |
 |  |  |  | 1.61 | 1.50 | 0.83 |
 |  | YY1+ | 293 | 1 | 16 | 276 |
 |  |  | 0.08 | 0.00 | 0.05 | 0.94 |
 |  |  |  | 0.04 | 0.32 | 1.25 |
CGI+ | Â | YY1+ | 261 | 1 | 10 | 250 |
 |  |  | 0.07 | 0.00 | 0.04 | 0.96 |
 |  |  |  | 0.05 | 0.23 | 1.27 |
CGI+ | Â | YY1- | 2,173 | 55 | 296 | 1,822 |
 |  |  | 0.61 | 0.03 | 0.14 | 0.84 |
 |  |  |  | 0.33 | 0.80 | 1.11 |
CGI- | Â | YY1- | 1,086 | 215 | 290 | 581 |
 |  |  | 0.31 | 0.20 | 0.27 | 0.53 |
 |  |  |  | 2.59 | 1.58 | 0.71 |
CGI- | Â | YY1+ | 32 | 0 | 6 | 26 |
 |  |  | 0.01 | 0.00 | 0.19 | 0.81 |
 |  |  |  | 0.00 | 1.11 | 1.08 |